R语言 xcms包 findPeaks.matchedFilter-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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findPeaks.matchedFilter-methods(xcms)
findPeaks.matchedFilter-methods()所属R语言包：xcms

                                        Feature detection in the chromatographic time domain
                                         色谱时域特征检测

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Find peaks in extracted the chromatographic time domain of the profile matrix.
中提取的轮廓矩阵色谱时域峰。


参数----------Arguments----------

参数：object
xcmsRaw object
xcmsRaw对象


参数：fwhm
full width at half maximum of matched filtration gaussian model peak. Only used to calculate the actual sigma, see below.  
在半最大匹配过滤高斯模型峰全宽。仅用于计算实际西格玛，见下文。


参数：sigma
standard deviation (width) of matched filtration model peak  
匹配过滤模型高峰的标准偏差（宽度）


参数：max
maximum number of peaks per extracted ion chromatogram  
％提取离子色谱峰的最大数量


参数：snthresh
signal to noise ratio cutoff
信号噪声比截止


参数：step
step size to use for profile generation
步长，使用个人资料的代


参数：steps
number of steps to merge prior to filtration
步骤合并之前过滤


参数：mzdiff
minimum difference in m/z for peaks with overlapping retention times  
差异最小的m / z为峰保留时间重叠


参数：index
return indicies instead of values for m/z and retention times  
返回序号为，而不是值，m / z和保留时间


参数：sleep
number of seconds to pause between plotting peak finding cycles  
暂停之间绘制峰寻找周期秒数


值----------Value----------

A matrix with columns:
一个矩阵的列：


参数：mz
weighted (by intensity) mean of peak m/z across scans  
加权（强度）意味着整个扫描峰的m / z


参数：mzmin
m/z of minimum step  
最小步长为m / z


参数：mzmax
m/z of maximum step  
最大步的m / z


参数：rt
retention time of peak midpoint  
高峰期的中点的保留时间


参数：rtmin
leading edge of peak retention time  
峰的保留时间的领先优势


参数：rtmax
trailing edge of peak retention time  
峰的保留时间后缘


参数：into
integrated area of original (raw) peak  
综合区原（原）高峰


参数：intf
integrated area of filtered peak  
综合过滤峰面积


参数：maxo
maximum intensity of original (raw) peak  
原（原）峰的最大强度


参数：maxf
maximum intensity of filtered peak  
最大过滤高峰强度


参数：i
rank of peak identified in merged EIC (<= max)  
在合并后的EIC确定峰值排名（<=max）


参数：sn
signal to noise ratio of the peak  
信号噪声比高峰


方法----------Methods----------

     findPeaks.matchedFilter(object, fwhm = 30, sigma = fwhm/2.3548, max = 5,      snthresh = 10, step = 0.1, steps = 2, mzdiff = 0.8 - step*steps,      index = FALSE, sleep = 0)   
     findPeaks.matchedFilter(object, fwhm = 30, sigma = fwhm/2.3548, max = 5,      snthresh = 10, step = 0.1, steps = 2, mzdiff = 0.8 - step*steps,      index = FALSE, sleep = 0)   


作者（S）----------Author(s)----------


Colin A. Smith, <a href="mailto:csmith@scripps.edu">csmith@scripps.edu</a>



参见----------See Also----------

findPeaks-methods xcmsRaw-class
findPeaks-methodsxcmsRaw-class

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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