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R语言 VariantAnnotation包 VAFilterResult-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:58:03 | 显示全部楼层 |阅读模式
VAFilterResult-class(VariantAnnotation)
VAFilterResult-class()所属R语言包:VariantAnnotation

                                        "VAFilterResult" for VAFilter output and statistics
                                         “VAFilterResult”VAFilter输出和统计

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Objects of this class are logical vectors indicating records passing the applied filter, with an associated data frame summarizing the name, input number of records, records passing filter, and logical operation used for all filters in which the result participated.
这个类的对象是逻辑向量,表示总结的名称,输入的记录数,记录通过过滤器,逻辑运算结果,在参加所有过滤器所使用的相关数据框,通过应用过滤器的记录。


用法----------Usage----------


VAFilterResult(data = GRanges(), x = logical(), name = NA_character_,
   subset = TRUE, input = length(x), passing = sum(x), op = NA_character_)
## S4 method for signature 'VAFilterResult,VAFilterResult'
Logic(e1, e2)
## S4 method for signature 'VAFilterResult'
name(x, ...)
stats(x, ...)
## S4 method for signature 'VAFilterResult'
show(object)



参数----------Arguments----------

参数:data
A linkS4class{GRanges} of the data to be filtered.  
一个linkS4class{GRanges}要过滤的数据。


参数:x, object, e1, e2
For VAFilterResult, logical() indicating records that passed filter or, for others, an instance of VAFilterResult class.  
VAFilterResult,logical()指示记录,通过过滤器,或为他人,VAFilterResult类的一个实例。


参数:name
character() indicating the name by which the filter is to be referred. Internally, name, input, passing, and op may all be vectors representing columns of a data.frame summarizing the application of successive filters.  
character()显示的名字,其中过滤器是被称为。在内部,name,input,passing,op都data.frame总结连续过滤器的应用程序的代表列的向量。


参数:subset
logical() when TRUE, the function returns a  subset of the data that passed the filter as a linkS4class{GRanges} object. The name and stats information are in the metadata slot. When FALSE, an object of  VAFilterResult is returned.  
logical()为TRUE时,函数返回的数据通过过滤器linkS4class{GRanges}对象的一个子集。 name和stats信息元数据插槽。如果为FALSE,VAFilterResult对象返回。


参数:input
integer() indicating the length of the original input.  
integer()表示原始输入的长度。


参数:passing
integer() indicating the number of records passing the filter.  
integer()显示通过过滤器的记录数量。


参数:op
character() indicating the logical operation, if any, associated with this filter.  
character()表示逻辑运算,如果有的话,与此过滤器相关联。


参数:...
Additional arguments, unused in methods documented on this page.  
额外的参数,未使用此页上记载的方法。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created through VAFilterResult, but these are automatically created by the application of vaFilter instances.
可以通过VAFilterResult创建对象,但这些都是自动由vaFilter实例的应用创建。


插槽----------Slots----------




.Data: Object of class "logical" indicating
.Data:Object类的"logical"说明




name: Object of class "ScalarCharacter" representing the name of the filter whose results are summarized. The name is either the actual name of the filter, or a combination of filter names and logical operations when the outcome results from application of several filters in a single
name:Object类的"ScalarCharacter"代表的过滤器的名称,其结果是总结。这个名字是滤波器的实际名称,或过滤器的名称和逻辑运算的组合,从几个过滤器的应用程序在一个单一的结果结果




stats: Object of class "data.frame" summarizing the name, input number of records, records passing filter, and logical operation used for all filters in which the result participated. The data.frame rows correspond either to
stats:Object类的"data.frame"总结的名称,输入的记录数,通过过滤器,逻辑运算结果,在参加所有过滤器使用的记录。 data.frame行到对应


方法----------Methods----------




Logic signature(e1 = "VAFilterResult", e2 =
逻辑的<code>签名(E1 =“VAFilterResult”,E2 =




! signature(x = "VAFilterResult"): Negate the outcome
! signature(x = "VAFilterResult"):否定的结果




name signature(x = "VAFilterResult"): The name of the
名称signature(x = "VAFilterResult"):名称




stats signature(x = "VAFilterResult"): a data.frame as described in the "Slots" section of
统计signature(x = "VAFilterResult"):data.frame中的“老虎机”一节所述




show signature(object = "VAFilterResult"): summary of
显示signature(object = "VAFilterResult"):总结


作者(S)----------Author(s)----------


Valerie Obenchain



参见----------See Also----------

vaFilter
vaFilter


举例----------Examples----------


## see ?vaFilter[#看到了什么?vaFilter]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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