twilight.teststat(twilight)
twilight.teststat()所属R语言包：twilight
Interface to the test statistics provided within 'twilight'
接口测试在“曙光”提供的统计数据
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A function to compute two-sample t, Z and fold change equivalent test statistics (paired or unpaired) and correlation coefficients.
一个函数来计算两样本t，Z和倍等效的检验统计量的变化（成对或不成对）和相关系数。
用法----------Usage----------
twilight.teststat(xin, yin, method = "fc", paired = FALSE, s0 = NULL)
参数----------Arguments----------
参数：xin
Either an expression set (ExpressionSet) or a data matrix with rows corresponding to features and columns corresponding to samples.
表达式集（ExpressionSet），或与相应样品的特点和列对应的行数据矩阵。
参数：yin
A numerical vector containing class labels. The higher label denotes the case, the lower label the control samples to test case vs. control. For correlation scores, yin can be any numerical vector of length equal to the number of samples.
数值向量类的标签。较高的标签表示的情况下，较低的标签控制样品测试的情况下与控制。相关分数，yin可以是任何长度等于样本数的数值向量。
参数：method
Character string: "fc" for fold change equivalent test (that is log ratio test), "t" for t-test, and "z" for Z-test of Tusher et al. (2001). With "pearson" or "spearman", the test statistic is either Pearson's correlation coefficient or Spearman's rank correlation coefficient.
字符串："fc"倍等效试验（即log比试验），"t"t检验，"z"Z检验Tusher等。 （2001年）。 "pearson"或"spearman"，检验统计量，要么是Pearson相关系数或Spearman秩相关系数。
参数：paired
Logical value. Depends on whether the samples are paired. Ignored if method="pearson" or method="spearman".
逻辑值。取决于是否配对样本。如果method="pearson"或method="spearman"忽略。
参数：s0
Fudge factor for variance correction in the Z-test. Takes effect only if method="z". If s0=NULL: The fudge factor is set to the median of the pooled standard deviations.
在Z-测试校正方差忽悠因素。只有生效method="z"。如果s0=NULL：蒙混因素汇集的标准偏差的中位数。
Details
详情----------Details----------
Please see vignette for detailed information.
有关详细信息，请参见暗角。
值----------Value----------
Returns a list with two components: a numerical vector of observed test statistics observed. Each entry corresponds to one row of the input data matrix. Also, the estimated fudge factor s0 is returned. In any other case except method="z", s0 is zero.
列表返回两部分组成：一个观测检验统计量的数值向量observed。每个条目对应的输入数据矩阵的一行。此外，估计软糖因素s0返回。在任何其他情况下，除了method="z"，s0是零。
作者（S）----------Author(s)----------
Stefanie Scheid <a href="http://www.molgen.mpg.de/~scheid">http://www.molgen.mpg.de/~scheid</a>
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
twilight.pval
twilight.pval
举例----------Examples----------
### Z-test on random values[＃Z检验随机值]
M <- matrix(rnorm(20000),nrow=1000)
id <- c(rep(1,10),rep(0,10))
stat <- twilight.teststat(M,id,method="z")
### Pearson correlation[＃Pearson相关]
id <- 1:20
stat <- twilight.teststat(M,id,method="pearson")
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发表于 2012-2-26 15:52:20
