R语言 tweeDEseq包 qqchisq()函数中文帮助文档(中英文对照)

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qqchisq(tweeDEseq)
qqchisq()所属R语言包：tweeDEseq

                                         Chi-square quantile-quantile plot
                                         卡方位数位数图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Make a chi-square quantile-quantile plot.
使卡方的位数，位数图。


用法----------Usage----------


qqchisq(stat, df=1, normal=FALSE, rangeExpected=FALSE, obsQuantiles=c(0.50, 0.75, 0.95), ...)



参数----------Arguments----------

参数：stat
vector of χ^2 statistics.  
向量χ^2统计数字。


参数：df
degrees of freedom of stat.  
度stat自由。


参数：normal
logical; set to TRUE if the χ^2 statistics in stat should be transform into normal z-scores in order to improve the display of lower quantiles. For this purpose, this function uses the zscoreGamma function from the limma package. Default is set to FALSE.  
逻辑;设置TRUE如果χ^2统计stat应进入正常的Z-分数转换，以改善低位数显示。为此目的，此功能使用zscoreGamma从limma包功能。默认设置FALSE。


参数：rangeExpected
logical; set to TRUE if the displayed range of the observed χ^2 statistics is restricted to the range of their expected values. Default is set to FALSE.  
逻辑;设置TRUE如果观测到的χ^2统计显示范围只限于他们的预期值的范围。默认设置FALSE。


参数：obsQuantiles
observed quantiles to indicate by horizontal dash lines. By default, these are set to 50%, 75% and 95%.  
观察位数水平虚线表明。默认情况下，这些被设定为50％，75％和95％。


参数：...
further arguments to pass to the plot function.  
进一步的参数传递给plot功能。


Details

详情----------Details----------

The main purpose of this function in the tweeDEseq package is to provide means to assess the goodness of fit of count data to the negative binomial distribution. The main input argument stats should be the output of gofTest.
此功能在tweeDEseq包的主要目的是提供手段来评估计数数据负二项分布的拟合优度。主要输入参数stats应该是输出gofTest。


值----------Value----------

it returns invisibly a list with two components x and y corresponding to the coordinates of the plotted statistics.
它返回无形两部分组成x和y相应的坐标绘制统计列表。


参考文献----------References----------

A flexible count data model to fit the wide diversity of expression profiles arising from extensively replicated RNA-seq experiments. Submitted.

参见----------See Also----------

compareCountDist testShapePT
compareCountDisttestShapePT


举例----------Examples----------


## Generate a random matrix of counts[＃生成随机数矩阵]
counts <- matrix(rPT(n=2000, a=0.5, mu=10, D=5), nrow=20)

## Perform the goodness-of-fit tests for every row in the matrix[＃执行矩阵中的每一行，善良的拟合试验]
chi2gof <- gofTest(counts)

## Not run: [＃无法运行：]
qqchisq(chi2gof)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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