TssResult-class(TSSi)
TssResult-class()所属R语言包:TSSi
Class TssResult
类TssResult
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Class TssResult storing final sequence read data with identified TSS.
类TssResult存储的最终序列确定TSS的读取数据。
插槽----------Slots----------
reads: List with the read data for each segment.
reads:每个段的只读数据的名单。
segments: Data frame with the information of the
segments:数据框的信息
tss: List of the identified TSS locations.
tss:名单确定的TSS位置。
annotation: Annotation data object, as passed through the
annotation:注释数据对象,通过
parameters: List with the parameters.
parameters:参数列表。
方法----------Methods----------
All methods for class TssNorm, as well as:
类的所有方法TssNorm,以及:
identify methods:
识别方法:
signature(x="TssNorm")
signature(x="TssNorm")
Identify TSS in the normalized data.
在规范化的数据确定TSS的。
get methods:
get方法:
signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")
Get the expectation for non-specific reads, seestart.
非特异性读取的期望,看到start。
signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")
Get the identified transcription start sites, seestart.
得到确定的转录起始位点,看到start。
signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")
Subset the object, by name or index.
子集对象的名称或索引。
asRangedData methods:
asRangedData方法:
signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")
Convert the tss predictions, as obtained by the tss method, to an object of class RangedData.
TSS预测,由tss方法获得,转换到一个对象类RangedData。
作者(S)----------Author(s)----------
Maintainer: Julian Gehring <julian.gehring@fdm.uni-freiburg.de>
参见----------See Also----------
Classes: TssData, TssNorm, TssResult
类别:TssData,TssNorm,TssResult
Methods: segmentizeCounts, normalizeCounts, identifyStartSites, get-methods, plot-methods, asRangedData-methods
方法:segmentizeCounts,normalizeCounts,identifyStartSites,get-methods,plot-methods,asRangedData-methods
Functions: subtract-functions
功能:subtract-functions
Data set: physcoCounts
数据集:physcoCounts
Package: TSSi-package
包装:TSSi-package
举例----------Examples----------
showClass("TssResult")
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注:
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