R语言 TSSi包 physcoCounts-data()函数中文帮助文档(中英文对照)

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physcoCounts-data(TSSi)
physcoCounts-data()所属R语言包：TSSi

                                        CAP capture data
                                         CAP捕捉数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Data of a 5'-CAP capture experiment, after mapping the reads to the genome.
一个5-第采集实验数据，绘制基因组的读取。


用法----------Usage----------


data(physcoCounts)



格式----------Format----------




physcoCounts Data frame with results from a 5'-CAP capture
physcoCounts数据框从5-CAP中捕获的结果




chromosome Chromosome the read is mapped to.
读取映射到染色体染色体。




region Predefined region based on annotations, which can be treated
区域预定义区域，基于注释，它可以被视为




start Start position, given as bp, of the 5' end of the
开始启动的位置，作为BP的5端，




strand Forward and reverse strand, given as '+' and '-',
正向链和反向链，+和 - ，




counts Number of reads at the respective position.
计数是在各自的位置读取。


Details

详情----------Details----------

The transcription data from Physcomitrella patens was mapped using the bowtie software. Then, the positions of 5' ends of each read were extracted and the number of reads at each position counted.
小立碗藓的转录数据被映射使用领结软件。然后，提取每个读5端的位置和数量在每个计数的位置读取。

For further details, please see the publication.
欲知详情，请参阅本刊物。


源----------Source----------

Rensing et al., 2011.
伦辛等。，2011。

in preparation
在筹备


参见----------See Also----------

Classes: TssData, TssNorm, TssResult
类别：TssData，TssNorm，TssResult

Methods: segmentizeCounts, normalizeCounts, identifyStartSites, get-methods, plot-methods, asRangedData-methods
方法：segmentizeCounts，normalizeCounts，identifyStartSites，get-methods，plot-methods，asRangedData-methods

Functions: subtract-functions
功能：subtract-functions

Data set: physcoCounts
数据集：physcoCounts

Package: TSSi-package
包装：TSSi-package


举例----------Examples----------


## load data set[＃加载数据集]
data(physcoCounts)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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