ts.pair(tspair)
ts.pair()所属R语言包：tspair
Calculation of top scoring pairs.
得分最高的对计算。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function calculates the pair of genes that show the maximum difference in ranking between two user specified groups. The function tspcalc() is the general version of this function that accepts eSets.
此函数计算一双的基因，这表明在两个用户之间的指定组排名的最大区别。的的功能tspcalc（）这个函数接受eSets普通版。
用法----------Usage----------
ts.pair(dat,grp)
参数----------Arguments----------
参数：dat
An m genes by n arrays matrix of expression data.
由n阵列基因表达数据矩阵M基因。
参数：grp
A group indicator with values 0 and 1 for the two groups.
一组两组值0和1的指标。
Details
详情----------Details----------
ts.pair() only works for two group classification. All the caveats for tspcalc() apply here, but this function only works for matrix and vector arguments, for a more general function see tspcalc(). The top scoring pairs methodology was originally described in Geman et al. (2004). and the unique TSP idea was described in Tan et al. (2005).
ts.pair（）只适用于两个组分类。所有的警告tspcalc（）在这里适用，但此功能仅适用于矩阵和向量参数，为一个更普遍的功能，看到tspcalc（）。对得分最高的方法最初是在杰曼等。 （2004年）。 Tan等描述和独特的TSP理念。 （2005年）。
值----------Value----------
A tsp object with elements:
一个元素茶匙对象：
参数：index
A two-column matrix where each row is a pair of indices from the data matrix achieving the top score
一个两列的矩阵，每一行是一个指数从数据矩阵对实现最高得分
参数：tspscore
The rank based score described in Geman et al. (2004), essentially the empirical average of sensitivity and specificity for the pair.
该排名基于得分杰曼等。 （2004年），本质上是对经验的平均灵敏度和特异性。
参数：score
The tie-breaking score described in Tan et al. (2005).
Tan等人描述决胜得分。 （2005年）。
参数：grp
The binary group indicator.
二元组指标。
参数：tspdat
Row i and row (i + Number of total TSPs) of this data matrix represent the expression data for the ith TSP pair.
i行和行（I +总茶匙）此数据矩阵表示为第i个TSP对表达数据。
参数：labels
The group labels for the two groups as defined by the grp variable.
组两组的标签由GRP变量的定义。
作者（S）----------Author(s)----------
Jeffrey T. Leek <a href="mailto:jtleek@jhu.edu">jtleek@jhu.edu</a>
参考文献----------References----------
Statist. Appl. in Genetics and Molecular Biology, 3, 2004.
profiles," Bioinformatics, 21: 3896-3904, 2005.
参见----------See Also----------
tspplot, tspcalc, tspsig,predict.tsp, summary.tsp
tspplot，tspcalc，tspsig，predict.tsp，summary.tsp
举例----------Examples----------
## Not run: [＃无法运行：]
## Load data[＃将数据]
data(tspdata)
tsp1 <- ts.pair(dat,grp)
tsp1$index
## End(Not run)[＃结束（不运行）]
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发表于 2012-2-26 15:47:20
