R语言 tspair包 predict.tsp()函数中文帮助文档(中英文对照)

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predict.tsp(tspair)
predict.tsp()所属R语言包：tspair

                                        Prediction based on a tsp object
                                         预测的基础上TSP的对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function can be used to predict outcome values for a data set based on a tsp object.  
此功能可以用来预测结果基于TSP的对象为设置数据值。


用法----------Usage----------


  ## S3 method for class 'tsp'
predict(object,dat=NULL,select=NULL,...)



参数----------Arguments----------

参数：object
A tsp object
TSP的对象


参数：dat
Can take two values: (a) an m genes by n arrays matrix of expression data or (b) an eSet object
可以取两个值：（一）由n阵列的M基因表达数据矩阵或（b）ESET对象


参数：select
An indicator of which TSP to use,defaults to the first TSP.
其中指标TSP使用，默认为第一TSP。


参数：...
Plotting arguments (ignored)                           
绘图参数（忽略）


Details

详情----------Details----------

predict() accepts a tsp object calculated on an expression set or gene expression matrix. If no other data set is included, the tsp predictions for the original data set are produced. If a second gene expression matrix or expression set is included, predict() looks for the gene names of the TSP in tspobj and attempts to match them in the rownames or featureNames of the gene expression matrix. If rownames or featureNames are not available, the prediction is based on the row numbers.  If a match is identified, predict() makes a prediction for each gene based on the output.
预测（）接受小勺表达组或基因表达矩阵计算的对象。如果没有其他数据集，包括原始数据集的TSP预测生产。如果第二个基因表达矩阵或表达式集，包括预测（）看茶匙tspobj和尝试匹配它们的基因表达矩阵的rownames或featureNames基因的名称。如果rownames或featureNames不可预测基础上的行数。如果发现匹配，预测（）使得基于输出的每一个基因的预测。


值----------Value----------


参数：predict
A class prediction for each array of dat based on the TSP from tspobj
一类为每个DAT阵列预测基础上从tspobj的TSP


作者（S）----------Author(s)----------


Jeffrey T. Leek <a href="mailto:jtleek@jhu.edu">jtleek@jhu.edu</a>



参考文献----------References----------

Statist. Appl. in Genetics and Molecular Biology, 3, 2004.
Bioinformatics, 21:3896-3904, 2005.

参见----------See Also----------

tspplot,ts.pair, tspcalc,tspsig,summary.tsp
tspplot，ts.pair，tspcalc，tspsig，summary.tsp


举例----------Examples----------


  ## Not run: [＃无法运行：]
  ## Load data[＃将数据]
  data(tspdata)

  ## Run tspcalc() on a data matrix and grp vector[＃运行数据矩阵和向量GRP tspcalc（）]
  tsp1 <- tspcalc(dat,grp)

  ## Get predictions for a new eSet or data matrix[＃获取一个新的ESET或数据矩阵预测]
  predict.tsp(tsp1,dat2,1)
  predict(tsp1,eSet2,1)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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