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R语言 topGO包 geneList()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:43:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
geneList(topGO)
geneList()所属R语言包:topGO

                                        A toy example of a list of gene identifiers and the respective p-values
                                         一个玩具例如基因标识和相应的p-值的列表

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The geneList data is compiled from a differential expression analysis of the ALL dataset. It contains just a small number of genes with the corespondent p-values. The information on where to find the GO annotations is stored in the ALL object.
geneListALL集的差异表达分析数据编制。它包含只是少数基因与共同被告的p值。在哪里可以找到的GO注释的信息存储在ALL对象。

The topDiffGenes function included in this dataset will select  the differentially expressed genes, at 0.01 significance level, from geneList.
将选择的topDiffGenes函数包含在这个数据集的差异表达的基因,在0.01显着水平,从geneList。


用法----------Usage----------


data(geneList)



源----------Source----------

Generated using the ALL gene expression data. See the "scripts" directory.
使用ALL基因表达数据生成。看到“脚本”目录。


举例----------Examples----------


data(geneList)

## print the object[#打印对象。]
head(geneList)
length(geneList)

## the number of genes with a p-value less than 0.01[#的基因数量比0.01的p值]
sum(topDiffGenes(geneList))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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