R语言 timecourse包 plotProfile()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotProfile(timecourse)
plotProfile()所属R语言包：timecourse

                                        Gene Temporal Profile Plot
                                         基因的时空剖面图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the longitudinal temporal profile of a gene.
一个基因图的纵向的时间分布。


用法----------Usage----------


plotProfile(object, stats=c("HotellingT2", "MB"), ranking=1, gid=NULL, gnames=NULL, desc=NULL,
type=c("p","l","b"), col=2:100, lty=1:100, pch=1:100, lwd=2, xlab="Time",
ylab="Expression", legloc=NULL, xlim=NULL, ylim=NULL, cex.main=1,...)



参数----------Arguments----------

参数：object
a MArrayTC object.
MArrayTC对象。


参数：stats
a character indicating which statistic the ranking is based on.
统计ranking基于字符。


参数：ranking
a numeric value giving the ranking of the gene to be plotted.
一个数值，使基因的排名要绘制。


参数：gid
an optional character giving the ID of the gene to be plotted.
要绘制一个可选的字符，使基因的ID。


参数：gnames
an optional character vector with the i_th element corresponds to the gene ID of the i_th gene in object$M.
可选的特征向量与i_th元素对应的i_thobject$M基因的基因ID。


参数：desc
an optional character vector with the i_th element corresponds to the gene description of the i_th gene in object$M.
可选的特征向量与i_th元素对应的i_thobject$M基因的基因描述。


参数：type
a character indicating the plot type, "p" for points, "l" for lines, and "b" for both.
字符显示的图类型，"p"分"l"行"b"都。


参数：col
a character or numeric vector giving the colors for different biological conditions. Default is 2:100.
字符或数字向量，给予不同的生物条件的颜色。默认2:100。


参数：lty
a character or numeric vector giving the line types for different replicates. Default is 1:100.
复制的字符或数字向量，给予不同的线路类型。默认1:100。


参数：pch
a character or numeric vector giving the point types for different replicates. Default is 1:100.
复制给点不同的类型的字符或数字向量。默认1:100。


参数：lwd
optional. The default sets to 2.
可选的。默认设置为2。


参数：xlab
character. The label for the x-axis.
字符。为x轴的标签。


参数：ylab
character. The label for the y-axis.  
字符。 y轴的标签。


参数：legloc
an optional vector giving the location of the legend.
一个可选的向量，让传说中的位置。


参数：xlim
an optional vector giving the upper- and lower- limits of x-axis.
一个可选的向量，使上层和X轴的限制。


参数：ylim
an optional vector giving the upper- and lower- limits of y-axis.
一个可选的向量，使上层和Y轴的低限。


参数：cex.main
optional. The default sets to 1
可选的。默认设置为1


参数：...
any other arguments passed onto plot
到plot通过任何其他参数


Details

详情----------Details----------

This function takes an object of MArrayTC as the input and plots the temporal profile of a single gene. The user can specify either the ranking based on stats or the gene ID of the gene to be plotted.   
这个函数需要一个对象MArrayTC作为输入和一个单一的基因时空剖面图。用户可以指定stats要绘制基因的基因ID为基础的排名。

See points for possible values for pch, col and cex.
看到pointspch，col和cex可能的值。

See mb.long for examples.
看到mb.long的例子。


作者（S）----------Author(s)----------


Yu Chuan Tai <a href="mailto:yuchuan@stat.berkeley.edu">yuchuan@stat.berkeley.edu</a>

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注：
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