calcBIC(stepNorm)
calcBIC()所属R语言包:stepNorm
Extract BIC from a Fitted Model
从拟合模型提取的BIC
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes the Bayesian Information Criterion for a fitted parametric model.
计算参数的拟合模型的贝叶斯信息准则。
用法----------Usage----------
calcBIC(fit, subset=TRUE, scale = 0, enp, loss.fun = square)
参数----------Arguments----------
参数:fit
fitted model; see details below
拟合模型;详见下文
参数:subset
A "logical" or "numeric" vector indicating the subset of points used to compute the fitted model.
“逻辑”或“数字”向量,表示用来计算拟合模型的子集点。
参数:scale
optional numeric specifying the scale parameter of the model; see scale in step.
可选的数字指定的模型尺度参数;scalestep。
参数:enp
equivalent number of parameters in the fitted model. If missing, the enp component from fit will be used.
同等数量的参数的拟合模型。如果丢失,enp从合适的组件将被使用。
参数:loss.fun
the loss function used to calculate deviance; the default uses the squared deviation from the fitted values; one could also use absolute deviations (abs).
损失函数用于计算偏差,默认使用的拟合值的平方差;也可以使用绝对偏差(abs)。
Details
详情----------Details----------
The argument fit can be an object of class marrayFit, in which case the residuals component from the marrayFit object will be extracted to calculate the deviance; the user can also pass in a numeric vector, in which case it will be interpreted as the residuals and the user needs to specify the argument enp.
参数fit对象可以是一个类的marrayFit,在这种情况下residuals组件的:marrayFit对象将被提取到的偏差计算,用户还可以通过在数字向量,在这种情况下,它会被解释为残差,用户需要指定的参数enp。
The criterion used is
使用的标准是
where L is the likelihood and enp the equivalent number of parameters of fit. For linear models (as in marrayFit), -2log{L} is computed from the deviance.
其中L是可能性和enpfit参数的同等数量。对于线性模型(如marrayFit)-2log{L}从计算的偏差。
k = log(n) corresponds to the BIC and is the penalty for the number of parameters.
k = log(n)对应的BIC是参数的数目的罚款。
值----------Value----------
A numeric vector of length 4, giving
向量的长度为4的数字,给
参数:Dev
the deviance of the fit.
fit偏差。
参数:enp
the equivalent number of parameters of the fit.
同等数量的参数fit。
参数:penalty
the penalty for number of parameters.
参数数目的罚款。
参数:Criterion
the Akaike Information Criterion for fit.
的fit赤池信息准则。
作者(S)----------Author(s)----------
Yuanyuan Xiao, <a href="mailto:yxiao@itsa.ucsf.edu">yxiao@itsa.ucsf.edu</a>, <br>
Jean Yee Hwa Yang, <a href="mailto:jean@biostat.ucsf.edu">jean@biostat.ucsf.edu</a>
参见----------See Also----------
AIC, deviance, calcAIC.
AIC,deviance,calcAIC。
举例----------Examples----------
## load in swirl data[#在漩涡数据加载]
data(swirl)
## fit a model[#拟合模型。]
fit <- fitWithin(fun="medfit")
## res is an object of class marrayFit[#res是类marrayFit的的对象]
res <- fit(swirl[,1])
## calculate BIC[#计算的BIC]
calcBIC(res)
## or could pass in the residual vector, but then argument "enp" needs to be specified[#或能够通过在剩余向量,但“ENP”的说法需要指定]
calcBIC(res$residual, enp=1)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|