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R语言 Starr包 plotRatioScatter()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:10:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
plotRatioScatter(Starr)
plotRatioScatter()所属R语言包:Starr

                                        Plot ratios of all possible combinations of IP and CONTROL
                                         IP和控制所有可能的组合的地积比率

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A matrix of pairwise scatterplots of the ratios is created. The lower panel shows the correlation of the data.
创建的比率成对散点图矩阵。较低的面板显示相关的数据。


用法----------Usage----------


plotRatioScatter(eSet, ip, control, density=F, sample=NULL, cluster=T, cex=1)



参数----------Arguments----------

参数: eSet
        an ExprssionSet or matrix, containing the data  
ExprssionSet或矩阵,包含数据


参数: ip
an integer, or boolean vector, that indicates, which columns in the ExpressionSet are IP experiments   
整数或布尔向量,这表明,在ExpressionSet列是IP实验


参数: control
an integer, or boolean vector, that indicates, which columns in the ExpressionSet are CONTROL or REFERENCE experiments  
一个整数,或布尔向量,这表明,这是在的ExpressionSet列控制或参考实验


参数: density
if TRUE, a density scatter plot is plotted. This plot shows the density of the data.  
如果为true,密度绘制散点图。此图显示的数据密度。


参数: sample
An integer, indicating the number of subsamples to take for the density scatterplot. This is only recommended if the data is very large, as the density computation takes some time.  </table>
一个整数,指示子样本的数量,密度散点图。这只是建议,如果数据量非常大,密度计算需要花费一些时间。 </ TABLE>


参数:cluster
if cluster=T, the experiments are clustered and similiar experiments are plotted together.
如果聚类= T,实验聚类和同级实验绘制在一起。


参数:cex
see ?par
看到了什么?看齐


作者(S)----------Author(s)----------


Benedikt Zacher <a href="mailto:zacher@lmb.uni-muenchen.de">zacher@lmb.uni-muenchen.de</a>



参见----------See Also----------

pairs, densityscatter
pairs,densityscatter


举例----------Examples----------


##[#]
points <- 10^4
x <- rnorm(points/2)
x <- c(x,x+2.5)
x <- sign(x)*abs(x)^1.3
y <- x + rnorm(points,sd=0.8)
z <- y*2
mat <- matrix(c(x,y,z), ncol=3)
colnames(mat) <- c("A", "B1", "B2")
plotRatioScatter(mat, c(TRUE, FALSE, FALSE), c(FALSE, TRUE, TRUE), density=TRUE)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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