plot(SSPA)
plot()所属R语言包:SSPA
Empirical cumulative distribution function of p-values of the pilot data
实证试验数据的p值的累积分布函数
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function plot plots an empirical cumulative distribution function of p-values of the pilot data. The test statistics that are given as input to PilotData-class are transformed to two-sided p-values either using the normal or Student t distribution.
函数plot绘制经验累积分布函数的P-值的试验数据。测试作为输入给定的统计PilotData-class转化为双面p值使用正常或学生t分布。
用法----------Usage----------
plot(x, y, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
object of class PilotData-class
对象类PilotData-class
参数:y
unused item
未使用的项目
参数:...
additional arguments given to plot or par
额外的参数给plot或par
Details
详情----------Details----------
Empirical cumulative distribution function of p-values. The line at angle of 45 degrees represents the theoretical CDF of a uniform distribution as expected when all genes are non-differentially expressed. An accumulation of p-values near zero indicates a certain number of differentially expressed genes.
p值的经验累积分布函数。在45度角的线代表均匀分布的理论民防如预期时,所有的基因都是非差异表达。积累的P-值接近零,表示一定的差异表达基因的数量。
作者(S)----------Author(s)----------
Maarten van Iterson
举例----------Examples----------
library(multtest)
data(golub)
teststat <- mt.teststat(golub, golub.cl)
table(golub.cl)
pd <- pilotData(name="golub", testStatistics=teststat, sampleSizeA=11, sampleSizeB=27)
hist(pd)
plot(pd)
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