computeZonenoise (sscore)
computeZonenoise ()所属R语言包:sscore
Computes zone noise
计算区域噪声
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes the noise (average standard error) of the probe intensities for a single Affymetrix GeneChip
计算为一个单一的Affymetrix基因芯片的探针强度的噪声(平均标准误差)
用法----------Usage----------
computeZonenoise(index, intensity, stdv, npixels, bgCells)
参数----------Arguments----------
参数:index
vector of indices for probes in the given zone
在给定区域的探针向量指数
参数:intensity
vector of intensities for the GeneChip
强度矢量的基因芯片
参数:stdv
vector of standard deviations for the GeneChip
向量的基因芯片的标准偏差
参数:npixels
vector containing number of pixels for each probe of the GeneChip
向量的基因芯片的探针对每个像素
参数:bgCells
number of background cells on the GeneChip
背景单元的基因芯片的数
Details
详情----------Details----------
Calculates the noise (average standard error) of the probes in a given zone, using the algorithms described in the Affymetrix Statistical Algorithms Description Document, for a single GeneChip. This is an internal function that will generally not be accessed directly.
计算噪声在某一区域的探针(平均标准误差),使用Affymetrix公司的统计算法描述文件中所描述的算法为一个单一的基因芯片。这是一个内部函数,一般不会直接访问。
值----------Value----------
the noise of the probes for the given array
在给定的数组中的噪音探针
注意----------Note----------
Based on Affymetrix MAS5 Statistical SDK source code http://www.affymetrix.com/Auth/support/developer/stat_sdk/STAT_SDK_source.zip,
基于Affymetrix公司MAS5统计SDK源代码http://www.affymetrix.com/Auth/support/developer/stat_sdk/STAT_SDK_source.zip的,
作者(S)----------Author(s)----------
Richard Kennedy <a href="mailto:rkennedy@vcu.edu">rkennedy@vcu.edu</a>
参考文献----------References----------
Inc., Santa Clara, CA, whitepaper. http://www.affymetrix.com/support/technical/whitepapers/sadd_whitepaper.pdf
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注:
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