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R语言 SRAdb包 IGVload()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:03:31 | 显示全部楼层 |阅读模式
IGVload(SRAdb)
IGVload()所属R语言包:SRAdb

                                         Load data into IGV via remote port call.
                                         装入IGV的数据通过远程停靠。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Loads data via a remote call to IGV.
通过远程调用来IGV的数据加载。


用法----------Usage----------


IGVload(sock, files)



参数----------Arguments----------

参数:sock
A socket connection to IGV.  
套接字连接IGV的。


参数:files
Character vector of one or more filenames with full path or urls to load. Among supported file types are BAM and IGV session file, for other file types  please check IGV web site: http://www.broadinstitute.org/igv/ControlIGV.  
一个或多个文件名的完整路径或URL加载的特征向量。在支持的文件类型是BAM和IGV的会议文件,请为其他文件类型,检查IGV的网站:http://www.broadinstitute.org/igv/ControlIGV。


作者(S)----------Author(s)----------



Sean Davis <sdavis2@mail.nih.gov>




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

startIGV, IGVgoto
startIGV,IGVgoto


举例----------Examples----------


  ## Not run: [#无法运行:]
  ## Create a file list from example bam files in the package[#创建一个文件列表BAM文件包]
  exampleBams = file.path(system.file('extdata',package='SRAdb'),
    dir(system.file('extdata',package='SRAdb'),pattern='bam$'))
  
  ## Create a socket connection to IGV[#创建一个套接字连接到IGV的]
  sock <- IGVsocket()
  ## Load the bam files into IGV[#加载的BAM文件到IGV的]
  IGVload(sock, exampleBams)
  
## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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