R语言 SQUADD包 SQUADD-package()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

SQUADD-package(SQUADD)
SQUADD-package()所属R语言包：SQUADD

                                        Collection of visualization tools to perform a SQUAD-based quantitative analysis
                                         可视化工具的集合，执行小队为基础的定量分析

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The SQUAD (Standardized Qualitative Dynamical Systems) software is dedicated to the analysis of boolean logical model(Di Cara et al 2007). It was the first tool to combine the traditional boolean approach and a continuous system. This novel feature permits the dynamical analysis of regulatory network in the absence of kinetic data. In order to get the best of this approach, we provide here a R package, SQUADD, a SQUAD add-on for : (i) simplify the visualization of the initial SQUAD simulation results. (ii) generate qualitative predictions of the component change between two conditions. (iii) Assess the coherence of a model by PCA analysis.
小队（标准化定性动力系统）软件致力于布尔逻辑模型分析（迪卡拉等人，2007年）。它是第一个工具，结合传统的布尔方法和连续系统。这种新颖的功能，允许在调控网络的动力学分析动力学数据的情况下。以这种方法得到的最好的，我们在这里提供SQUADD，R包，添加上一队：（一）简化了最初的阵容模拟结果的可视化。 （二）产生的两个条件之间的成分变化的定性预测。 （三）评估PCA分析模型的一致性。


Details

详情----------Details----------


作者（S）----------Author(s)----------



Martial Sankar  <martial.sankar@unil.ch>




参考文献----------References----------

Dominik M Wittmann, Jan Krumsiek, Julio Saez-Rodriguez, Douglas A Lauffenburger, Steffen Klamt and Fabian J Theis (2009) Transforming Boolean models to continuous models: methodology and application to T-cell receptor signaling. PLOS Computational Biology 3: 98
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。