R语言 spotSegmentation包 plot.spotseg()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plot.spotseg(spotSegmentation)
plot.spotseg()所属R语言包：spotSegmentation

                                        Microarray Spot Segmentation Plot
                                         芯片现货分割图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot method for the spotseg function. Displays the result
spotseg函数图法。显示结果


用法----------Usage----------


plot(x,...)



参数----------Arguments----------

参数：x
An object of class "spotseg", which is the output of the function spotseg.
一个对象的类"spotseg"，是输出功能spotseg。


参数：...
Unused but required by generic "plot" method.  
未使用的，但需要通用的"plot"方法。


值----------Value----------

None, other than the displayed plot.
没有，比其他显示图。


参考文献----------References----------

Robust model-based segmentation of microarray images,\  Technical Report No.~473, Department of Statistics, University of Washington, January 2005.

参见----------See Also----------

spotseg
spotseg


举例----------Examples----------


data(spotSegTest)

# columns of spotSegTest:[对spotSegTest的列：]
#  1 intensities from the Cy3 (green) channel[1，从强度Cy3标记（绿色）通道]
#  2 intensities from the Cy5 (red) channel[2，从强度的Cy5的（红色）通道]

dataTransformation <- function(x) (256*256-1-x)^2*4.71542407E-05

chan1 <- matrix(dataTransformation(spotSegTest[,1]), 144, 199)
chan2 <- matrix(dataTransformation(spotSegTest[,2]), 144, 199)

hivGrid <- spotgrid( chan1, chan2, rows = 4, cols = 6, show = TRUE)

library(mclust)

hivSeg <- spotseg( chan1, chan2, hivGrid$rowcut, hivGrid$colcut)

plot(hivSeg)

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注：
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