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R语言 splots包 plotScreen()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:00:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
plotScreen(splots)
plotScreen()所属R语言包:splots

                                        Plot a false-color representation of screening data
                                         筛选数据绘制的假色表示

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

plotScreen produces a false-color representation of screening data from multiple plates (typical use case: dozens of plates) in a single plot.
plotScreen产生筛选数据从多个板块的假色代表(典型的用例:几十个板块)在一个单一的图。


用法----------Usage----------


plotScreen(z,
           ncol = 6L,
           zrange,
           main = "",
           do.names = TRUE,
           do.legend = TRUE,
           legend.label = deparse(substitute(z)),
           nx = 24,
           ny = 16,
           fill,
           na.fill = "grey" ,
           do.grid.newpage = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:z
A list of plate data. Each element provides data for a plate and is expected to be a vector of length at least nx*ny (only the first nx*ny elements will be displayed). The values are assumed to come in row-by-row order, e.g. A1, A2, A3, ..., B1, B2, ... Alternatively, the elements of z can be factors that represent well or spot classes (e.g. the different types of controls, empty wells, wells with reagent of interest).  
铭牌数据列表。每个元素提供了一盘数据,预计将是一个长度的向量至少nx*ny(只在第一个nx*ny元素将被显示)。假设值来排排顺序,例如格A1,A2,A3,...,B1,B2的,...另外,z元素可以代表或现货类(如不同类型的控制,空井,井与试剂利益)的因素。


参数:ncol
Integer of length 1. Number of columns (plates in one row) for the plot.
长度为1的整数。积数列(一列排开板)。


参数:zrange
If the elements of z are numeric, then this optional parameter can be used to specify the numeric range that is mapped to the color scale; by default, a symmetric interval around the median of unlist(z) is used. If the elements of z are factors, then this optional parameter can be used to specify the total ordered set of factor levels; by default, the union of the levels of the elements of z is used.
如果z的元素是数字,那么这个可选参数可以用来指定数字范围的色阶映射到默认情况下,各地的中位数为unlist(z)对称区间使用。如果z元素的因素,那么这个可选参数可以用于指定总下令因子水平;默认情况下,工会各级z元素的使用。


参数:fill
If the elements of z are numeric, then this parameter can be used to specify a character vector of color names used to create a color ramp for the false color data representation. The default colors correspond to blue for low values, white for the middle of the range and red for high values. If the elements of z are factors, then this parameter can be used to define the corresponding color names; by default, a palette from RColorBrewer is used.  
如果z的元素是数字,那么这个参数可以用来指定用于创建一个假彩色数据表示的颜色渐变的颜色名称的特征向量。默认的颜色对应值低,中间高值的范围和红色白色蓝色。如果元素的z的因素,那么这个参数可以用来定义相应的颜色名称;默认情况下,从RColorBrewer使用的调色板。


参数:main
Character of length 1 or plotmath expression used for the plot title. To omit, set this argument to length 0, to the empty character "", to FALSE or to NULL.
用于积标题字符长度为1或plotmath表达。省略,将此参数设置为长度为0,以空字符"",FALSE或NULL。


参数:do.names
Logical specifiying if plate captions should be plotted.
逻辑specifiying板标题应绘制。


参数:do.legend
Logical specifying if a legend for false color values should be output.
逻辑指定假色值的一个传奇,如果应该输出。


参数:legend.label
Character of length 1 or plotmath expression that is printed next to the legend (see vignette for examples). To omit, set this argument to length 0, to the empty character "", to FALSE or to NULL.
字符长度为1或印传说(见例子插曲)plotmath表达。省略,将此参数设置为长度为0,以空字符"",FALSE或NULL。


参数:nx
An integer for the number of columns in a plate. Default 24 for a 384-well plate.
一盘数列的整数。 24默认为384孔板。


参数:ny
An integer for the number of rows in a plate. Default 16 for a 384-well plate.
一个板块中的行数的整数。 16默认为384孔板。


参数:na.fill
Color for NA values.
关于NA值的颜色。


参数:do.grid.newpage
Logical, if TRUE, then the function grid.newpage is called at the begin of this function.
逻辑,如果TRUE,然后函数grid.newpage被称为在开始此功能。


值----------Value----------

None. The function is called for its side effect.
没有。该功能被称为其副作用。


作者(S)----------Author(s)----------


Wolfgang Huber, based on an earlier version by Oleg Sklyar.



举例----------Examples----------


  screen = lapply(1:12, function(i) cumsum(rnorm(384)))
  plotScreen(screen, ncol=3, fill=c("white", "darkblue"))

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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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