R语言 splicegear包 as.data.frame.SpliceExprSet()函数中文帮助文档(中英文对照)

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as.data.frame.SpliceExprSet(splicegear)
as.data.frame.SpliceExprSet()所属R语言包：splicegear

                                        SpliceExprSet object to data.frame converter
                                         SpliceExprSet对象数据框转换

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Converts a SpliceExprSet object to a data.frame.
转换数据框SpliceExprSet的对象。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'SpliceSites'
as.data.frame(x, row.names = NA, optional = NA, ...)

## S3 method for class 'SpliceExprSet'
as.data.frame(x, row.names = NA, optional = NA, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
object SpliceSites-class or SpliceExprSet-class.
对象SpliceSites-class或SpliceExprSet-class。


参数：row.names
NULL or a character vector giving the row names for the data frame.  Missing values are not allowed.
NULL或特征向量，使数据框的行名。遗漏值是不允许的。


参数：optional
logical. If TRUE, setting row names is optional.
逻辑。如果TRUE，设置行名称是可选的。


参数：...
currently ignored.
目前被忽略。


Details

详情----------Details----------

Data are traditionally stored in objects of class data.frame. This function links the object-oriented design of the package with the large amount of functions working on data.frames.
传统的数据存储类data.frame的对象。此功能连接大量的工作职能上data.frames包的面向对象的设计。


值----------Value----------

A data.frame. For both functions the first column names are begin, end, isintypeI, isintypeII, exprs and genenames. In the case of as.data.frame.SpliceExprSet, the next variable names will the ones in the AnnotatedDataFrame-class attribute of the  ExpressionSet-class object belonging the  SpliceExprSet-class. The last variable names will be the ones in the slot info of the Probes-class object.
Adata.frame。对于这两个函数的第一个列名begin，end，isintypeI，isintypeII，exprs和genenames。在as.data.frame.SpliceExprSet未来的变量名的AnnotatedDataFrame-classExpressionSet-class对象的属性的，属于SpliceExprSet-class。最后一个变量的名称将是那些在槽infoProbes-class对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Laurent Gautier



举例----------Examples----------


data(spliceset)

dataf <- as.data.frame(spliceset)

lm.panel <- function(x, y, ...) {
                                  points(x,y,...)
                                  p.lm <- lm(y~x); abline(p.lm)
                                }

## probe intensity values conditioned by the position of the probes on[＃探针强度值条件由探针的位置上]
## the mRNA[＃的mRNA]
coplot(log(exprs) ~ Material | begin, data=dataf, panel=lm.panel)

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