R语言 spkTools包 spkGNN()函数中文帮助文档(中英文对照)

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spkGNN(spkTools)
spkGNN()所属R语言包：spkTools

                                        Genes Needed to Detect N True Positives
                                         需要检测的基因列印真阳性

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computes the number of genes one would need to consider to obtain a given number of truly positive genes if one considered genes in order of decreasing observed fold change.
计算需要考虑获得真正正的基因数目，如果一位代表认为为了减少观察倍变化的基因的基因数目。


用法----------Usage----------


spkGNN(n, n.expr, n.unexpr, AccuracySlope, AccuracySD, nullfc)



参数----------Arguments----------

参数：n
the desired number of true positives
所需数量的真阳性


参数：n.expr
the actual number of truly expressed genes
真正表达基因的实际人数


参数：n.unexpr
the actual number of truly unexpressed genes
真正未表达的基因的实际数量


参数：AccuracySlope
the signal detect slope from the spkSlope function
信号检测斜坡从spkSlope功能


参数：AccuracySD
the standard deviation of the signal detect slope from the spkAccSD function
信号的标准偏差检测斜坡从spkAccSD功能


参数：nullfc
a vector of null fold changes from the spkBox function   
空倍从spkBox的函数变化的矢量


值----------Value----------

This function returns the expected number of genes one would have to consider to obtain N true positives under the given conditions.
此函数返回预期的基因数目将不得不考虑在给定的条件下获得N真阳性。


作者（S）----------Author(s)----------


Matthew N. McCall



举例----------Examples----------


data(affy)
spkSlopeOut <- spkSlope(affy)
spkBoxOut <- spkBox(affy, spkSlopeOut, fc=2)
AccuracySlope <- round(spkSlopeOut$slope[-1], digits=2)
AccuracySD <- round(spkAccSD(affy, spkSlopeOut), digits=2)
spkGNN(n=25, n.expr=100, n.unexpr=10000, AccuracySlope[2],
AccuracySD[2], spkBoxOut[[2]])

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