spikeLI-package(spikeLI)
spikeLI-package()所属R语言包:spikeLI
Analysis of Affymetrix spike-in data (HGU95 and HGU133 Latin square) using the Langmuir Isotherm.
穗Affymetrix公司的分析数据(HGU95和HGU133拉丁方)使用Langmuir等温。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
spikeLI performs a series of analysis of Affymetrix spike-in data using inputs from physical-chemistry. It illustrates the advantages of such approach in determining expression levels and in identifying outliers compared to other methods. The analysis so far is restricted to spike-in genes. It will be extended to a generic CEL file. spikeLI does not require affy (and it is independent of any other bioconductor packages) as it reads spike-in data from a data frame variable hgu which is contained in the package.
spikeLI执行一系列分析Affymetrix公司,尖峰数据从物理化学的投入。它说明了这种方法的优点在确定表达水平和与其他方法相比,在确定离群。分析迄今只限于穗基因。这将延长到一个通用的CEL的文件。 spikeLI不需要affy,(它是独立于任何其他bioconductor包),因为它读取穗在数据从一个数据框HGU这是包中包含的变量。
Details
详情----------Details----------
The package contains three basic functions: - Ivsc plot intensities as function of spike-in concentration for a fixed probe. - IvsDG plot intensities as function of affinity for a given probe set at fixed concentration. - collapse plot of intensities both as a function of concentration and affinities.
该软件包包含三个基本功能: - IVSC积穗在一个固定的探针浓度的功能强度。 - IvsDG积强亲和力的功能,在固定浓度的探针组。 - 崩溃强度,浓度和亲和力的功能图。
作者(S)----------Author(s)----------
Delphine Baillon, Paul Leclercq, Sarah Ternisien, Thomas Heim and Enrico Carlon
Maintainer: Enrico Carlon <enrico.carlon@polytech-lille.fr>
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
collapse, Ivsc, IvsDG, hgu, SPIKE_IN, SPIKE_INA, SPIKE_INB, SPIKE_INH , SPIKE_IN95
collapse,Ivsc,IvsDG,hgu,SPIKE_IN,SPIKE_INA,SPIKE_INB,SPIKE_INH,SPIKE_IN95
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|