expSetSpeCondExample(SpeCond)
expSetSpeCondExample()所属R语言包:SpeCond
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
expSetSpeCondExample is an ExpressionSet example object used as an example for the SpeCond package. This ExpressionSet only contains an expression matrix and the phenoData. This object has only the purpose of illustrating how SpeCond can be used with an ExpressionSet input object.
expSetSpeCondExample是ExpressionSet的例子作为为SpeCond包的例子使用的对象。此ExpressionSet仅包含一个表达式矩阵的phenoData的。这个对象有只说明如何SpeCond可用于一个ExpressionSet输入对象的目的。
用法----------Usage----------
data(expSetSpeCondExample)
格式----------Format----------
The format is: Formal class 'ExpressionSet' [package "Biobase"] with 7 slots ..@ phenoData :Formal class 'AnnotatedDataFrame' [package "Biobase"] with 4 slots .. .. ..@ varMetadata :'data.frame': 2 obs. of 1 variable: .. .. .. ..$ labelDescription: chr [1:2] "Tissue names" "Experience number" .. .. ..@ data :'data.frame': 64 obs. of 2 variables: .. .. .. ..$ Tissue: Factor w/ 32 levels "Adrenal_cortex",..: 23 23 5 5 1 1 16 16 32 32 ... .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr [1:64] "S_1" "S_2" "S_3" "S_4" ... .. .. .. ..$ Exp : Factor w/ 2 levels "Exp1","Exp2": 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 ... .. .. .. .. ..- attr(*, "names")= chr [1:64] "S_1" "S_2" "S_3" "S_4" ... .. .. ..@ dimLabels : chr [1:2] "sampleNames" "sampleColumns" .. .. ..@ .__classVersion__:Formal class 'Versions' [package "Biobase"] with 1 slots .. .. .. .. ..@ .Dataist of 1 .. .. .. .. .. ..$ : int [1:3] 1 1 0
格式是:正规类的ExpressionSet“包”BIOBASE“]与7个插槽.. @ phenoData:正式类的AnnotatedDataFrame”包“BIOBASE”] 4槽...... .. .. @ varMetadata:“数据框”:2 OBS。 1变量:.. .. .. .. $ labelDescription:CHR [1:2]“组织名称”,“体验号”...... .. .. @数据:“数据框”:64 OBS。 2个变量:...... .. .. .. $组织因素W / 32的水平“Adrenal_cortex”,..:23 23 5 5 1 1 16 16 32 32 ... .. .. .. .. .. - ATTR(*,“名”)= CHR [1:64]“S_1”S_2“,”S-3“,”S_4“... .. .. .. .. $ EXP:系数W / 2级是“exp1”,“EXP2”:1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 ... .. .. .. .. .. - ATTR(*,“名”)= CHR [1:64]“S_1”S_2“,”S-3“,”S_4“... .. .. .. @ dimLabels:CHR [1:2]“sampleNames”的“sampleColumns”...... .. .. @ __classVersion__类的正式版本“[包”BIOBASE“] 1插槽...... .. .. .. 。.. @数据:1 .. .. .. .. .. .. $:INT [1:3] 1 1 0
作者(S)----------Author(s)----------
Florence Cavalli, florence@ebi.ac.uk
参见----------See Also----------
getMatrixFromExpressionSet
getMatrixFromExpressionSet
举例----------Examples----------
data(expSetSpeCondExample)
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注:
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