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R语言 snpStats包 write.SnpMatrix()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:49:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
write.SnpMatrix(snpStats)
write.SnpMatrix()所属R语言包:snpStats

                                        Write a SnpMatrix object as a text file
                                         作为一个文本文件写SnpMatrix对象

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function is closely modelled on write.table. It writes an object of class SnpMatrix as a text file with one line for each row of the matrix. Genotpyes are written in numerical form, i.e. as 0, 1 or 2 (where 1 denotes heterozygous) or, optionally, as a pair of alleles (each coded 1 or 2).
此功能密切仿照write.table。它写入一个对象类SnpMatrix作为一个矩阵的每一行的行的文本文件。 genotpyes以数字形式被写入,即0,1或2个(其中1表示杂合子),或选择性,作为一对等位基因(每个编码1或2)。


用法----------Usage----------


write.SnpMatrix(x, file, as.alleles= FALSE, append = FALSE, quote = TRUE, sep = " ", eol = "\n", na = "NA", row.names = TRUE, col.names = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:x
The object to be written  
要写入的对象


参数:file
The name of the output file
输出文件的名称


参数:as.alleles
If TRUE, write each genotype as two alleles
如果TRUE,写两个等位基因,每个基因型


参数:append
If TRUE, the output is appended to the designated file. Otherwise a new file is opened
如果TRUE输出追加到指定的文件。否则,一个新的文件被打开


参数:quote
If TRUE, row and column names will be enclosed in quotes
如果将包含在引号TRUE,行和列名


参数:sep
The string separating entries within a line
行内字符串分隔条目


参数:eol
The string terminating each line
每行终止字符串


参数:na
The string written for missing genotypes
缺失基因型写的字符串


参数:row.names
If TRUE, each row will commence with the row name
如果TRUE,每行开始,该行名称


参数:col.names
If TRUE, the first line will contain all the column names
如果TRUE,第一行会包含所有的列名


值----------Value----------

A numeric vector giving the dimensions of the matrix written
一个数值向量,给予书面矩阵尺寸


作者(S)----------Author(s)----------


David Clayton <a href="mailto:david.clayton@cimr.cam.ac.uk">david.clayton@cimr.cam.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

write.table, SnpMatrix-class,
write.table,SnpMatrix-class

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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