R语言 snpStats包 read.impute()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

read.impute(snpStats)
read.impute()所属R语言包：snpStats

                                         Read genotypes imputed by the IMPUTE2 program
                                         阅读由IMPUTE2方案打杀的基因型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The IMPUTE2 program generates, for each SNP and each subject,  posterior probabilities for the three genotypes. This function reads such data as a SnpMatrix object, storing the posterior probabilities to as much accuracy allowed by a one-byte coding
IMPUTE2程序产生，每个SNP和每一个主题，三种基因型的后验概率。此功能SnpMatrix对象读取数据的后验概率，存储一个字节编码所允许的尽可能多的准确性


用法----------Usage----------


read.impute(file, rownames = NULL, nsnp = NULL, snpcol = 2)



参数----------Arguments----------

参数：file
The input file name. This file my be gzipped.  
输入文件名。这个文件我是用gzip压缩的。


参数：rownames
The row names for the output object. Note that these correspond to groups of three columns in the input file. If not supplied, names are generated as Sample1, Sample2 etc.  
输出对象的行名。请注意，这些对应输入文件中的三列组。如果没有提供，Sample1，Sample2等名称产生


参数：nsnp
The number of SNPs to be read in. This corresponds with the number of lines in the input file. If not supplied, the function does a preliminary pass to determine the number of lines  
被读入输入文件中的行的数量与此对应的SNPs。如果没有提供的功能做了初步确定的行数通


参数：snpcol
Which column of the input will be used as the SNP name. Default is column 2   
SNP的名称将被用作输入列。默认是2列


Details

详情----------Details----------

No provision is made for data for the X chromosome. Such data must be first read as a SnpMatrix and subsequently coerced to an XSnpMatrix object
没有经费，用于在X染色体上的数据。这些数据，必须先读为SnpMatrix“，随后强迫XSnpMatrix对象


值----------Value----------

an object of class SnpMatrix
一个对象类SnpMatrix


作者（S）----------Author(s)----------


David Clayton <a href="mailto:david.clayton@cimr.cam.ac.uk">david.clayton@cimr.cam.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

SnpMatrix-class
SnpMatrix-class


举例----------Examples----------


##---- No example available yet[＃----还没有例子可]

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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