compareSegmentations(snapCGH)
compareSegmentations()所属R语言包:snapCGH
Function for comparing segmentation methods to a known truth
功能分割方法比较已知的真理
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function takes a SegList and compares the breakpoints indicated in other SegLists with this original one.
这个函数接受一个SegList比较在其他SegLists表示用这种原始的断点。
用法----------Usage----------
compareSegmentations(TrueSeg,offset = 0,...)
参数----------Arguments----------
参数:TrueSeg
An object of class SegList which is scored against. Normally the output from simulateData.
一个对象类SegList对得分。通常情况下,输出从simulateData。
参数:offset
Integer value between 0 and 2 specifying how close (in number of clones) to a true breakpoint the segmentation method must be before it is scored.
Integer值介于0和2指定如何密切(克隆数)到一个真正的断点分割方法前必须将它拿下。
参数:...
One or more objects of class SegList. These are compared to TrueSeg.
SegList类的一个或多个对象。这些都是比较到TrueSeg。
值----------Value----------
The method returns a list containing two matrices. The first of these, \$TPR, contains the true positive rate, whilst the second, \$FDR, holds the false discovery rate. Both of these matrices are arranged such that a row represents a segmentation method and each column is an array.
该方法返回一个列表,其中包含两个矩阵。这些第一,\ $的TPR,包含真正的阳性率,而第二,\ $FDR,持有虚假的发现率。这两个矩阵排列,行代表一个分割方法和每一列是一个数组。
作者(S)----------Author(s)----------
John Marioni and Mike Smith
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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