SMAPHMM-class(SMAP)
SMAPHMM-class()所属R语言包:SMAP
Class "SMAPHMM": A class to manage HMMs for the SMAP package
类“SMAPHMM”:A类管理的SMAP的包的HMM模型
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Holds parameters for a Hidden Markov Model (HMM) used in
持有使用隐马尔可夫模型(HMM)的参数
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects should not be created directly but via the constructor function SMAPHMM.
不应直接创建对象,而是通过构造函数SMAPHMM。
插槽----------Slots----------
A: Object of class "matrix" The transition
A类"matrix"过渡对象
Pi: Object of class "numeric" The initial
Pi:Object类的"numeric"初始
Phi: Object of class "matrix" A matrix that specifies the paramaters of Gaussian distributions associated with each hidden state. The first column specifies standard deviations,
Phi类"matrix"A矩阵,指定每个隐藏状态的高斯分布paramaters对象。第一列指定的标准偏差,
noStates: Object of class "numeric" The number
noStates类"numeric"对象
Z: Object of class "matrix" Matrix of
Z:Object类的"matrix"矩阵
Y: Object of class "numeric" Vector of
Y:Object类的"numeric"矢量
eta: Object of class "ANY". Internal slot.
eta类"ANY"的对象。内部插槽。
grad: Object of class "ANY". Internal slot.
grad类"ANY"的对象。内部插槽。
方法----------Methods----------
A signature(object = "SMAPHMM"): Returns the
一个signature(object = "SMAPHMM"):返回
Pi signature(object = "SMAPHMM"): Returns the initial
PIsignature(object = "SMAPHMM"):返回初始
Phi signature(object = "SMAPHMM"): Returns the
披signature(object = "SMAPHMM"):返回
noStates signature(object = "SMAPHMM"): Returns the
noStatessignature(object = "SMAPHMM"):返回
作者(S)----------Author(s)----------
Robin Andersson, <a href="mailto:robin.andersson@lcb.uu.se">robin.andersson@lcb.uu.se</a>
参考文献----------References----------
Sandgren, J., Hvidsten, T. R., Diaz de Stahl, T., Dumanski, J. P., Komorowski, J., A Segmental Maximum A Posteriori Approach to Array-CGH Copy Number Profiling, submitted
参见----------See Also----------
smap, SMAPHMM
smap,SMAPHMM
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