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R语言 SLqPCR包 vandesompele()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:31:10 | 显示全部楼层 |阅读模式
vandesompele(SLqPCR)
vandesompele()所属R语言包:SLqPCR

                                         Data set of Vandesompele et al (2002)
                                         Vandesompele等数据集(2002)

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set was used in Vandesompele et al (2002) to demonstrate normalization  of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of housekeeping genes.
该数据集被用来在Vandesompele等(2002),以实时定量RT-PCR看家基因的几何平均数据表明标准化。


用法----------Usage----------


data(vandesompele)



格式----------Format----------

A data frame with 85 observations on the following 10 variables which stand for  expression data of ten commonly used housekeeping genes
一个数据框在以下10个站10个常用的看家基因表达数据的变量85意见




ACTB actin, beta
ACTB肌动蛋白,β




B2M beta-2-microglobulin
B2Mβ-2-微球蛋白




GAPD glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
GAPD3  - 磷酸甘油醛脱氢酶




HMBS hydroxymethylbilane synthase
HMBS的hydroxymethylbilane合酶




HPRT1 hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1
HPRT1次黄嘌呤磷酸1




RPL13A ribosomal protein L13a
RPL13A核糖体蛋白L13A




SDHA succinate dehydrogenase complex subunit A
SDHA琥珀酸脱氢酶复杂的A亚基




TBP TATA box binding protein
TBPTATA盒结合蛋白




UBC ubiquitin C
UBC泛素C




YWHAZ tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide
YWHAZ酪氨酸3-monooxygenase/tryptophan 5单加氧酶激活蛋白,泽塔多肽


Details

详情----------Details----------

The row names of this data set indicate the various human tissues which were investigated.
这组数据的列名指示的各种人体组织进行了调查。




BM 9 normal bone-marrow samples
9骨髓正常的骨髓样本




POOL 9 normal human tissues from pooled organs (heart, brain, fetal brain, lung, trachea, kidney, mammary gland, small intestine and uterus)
池9正常人体组织汇集器官(心,脑,胎儿的大脑,肺,气管,肾,乳腺,小肠和子宫)




FIB 20 short-term cultured normal fibroblast samples from different individuals
纤维蛋白原20短期培养来自不同个体的正常成纤维单元样品




LEU 13 normal leukocyte samples
LEU的13例正常白单元样本




NB 34 neuroblastoma cell lines (independently prepared in different labs from different patients)
注34神经母单元瘤单元株(独立准备从不同的病人在不同的实验室)


源----------Source----------

The data set was obtained from http://genomebiology.com/content/supplementary/gb-2002-3-7-research0034-s1.txt
得到的数据集从http://genomebiology.com/content/supplementary/gb-2002-3-7-research0034-s1.txt


参考文献----------References----------

normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging  of multiple internal control genes.  Genome Biology 2002. 3(7):research0034.1-0034.11. http://genomebiology.com/2002/3/7/research/0034/

举例----------Examples----------


data(vandesompele)
str(vandesompele)
rownames(vandesompele)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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