R语言 SLGI包 getUniquePairs()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getUniquePairs(SLGI)
getUniquePairs()所属R语言包：SLGI

                                         Find unique pairs from an genetic interaction matrix.  
                                         从遗传相互作用矩阵独特的双。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

getUniquePairs can find all the unique pairs from an interaction matrix and supplementary array genes, or finds only the unique pairs that shows positive interaction.
getUniquePairs可以找到所有的独特的对交互矩阵和补充阵列基因，或发现只显示对良性互动的独特。


用法----------Usage----------


getUniquePairs(iMat, respV = character(0), only = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：iMat
Adjacency matrix reporting genetic Interactions. Each entry has value 0 or 1, representing positive or negative interaction of corresponding pairs of row and column, respectively.
邻接矩阵报告遗传相互作用。每个条目都有值0或1，表示积极或消极的相互作用相应的对行和列分别。


参数：respV
Character vector of all gene names that were tested (found to interact or not)
特征向量的所有基因进行名称（发现交互或不）


参数：only
has default value FALSE, if TRUE, then only reports the positively interacted pairs.  
有默认值FALSE如果TRUE，然后只报告对积极互动。


值----------Value----------

A data.frame with two or three columns.  The first two columns are the query gene name and the array gene name, respectively.  If only is TRUE, the third column shows the interaction status.
一个，两个或三个列的数据框。前两列是基因名称的查询和阵列基因名称，分别为。 only如果是TRUE，第三列显示的互动状态。


作者（S）----------Author(s)----------


Z. Jiang



参见----------See Also----------

getSharedDomains
getSharedDomains


举例----------Examples----------


intM <- c(0,1,0,0,1,1,0,0,1,0,0,1,1,0,1,0)
dim(intM) <- c(4,4)
dimnames(intM) <- list(c("p1","p2","p3","p4"),c("p1","p3","p5","p7") )
respV <- c("p6","p8")
intM
getUniquePairs(intM,respV,only=FALSE)
getUniquePairs(intM,respV,only=TRUE)
getUniquePairs(intM,only=FALSE)
getUniquePairs(intM,only=TRUE)

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