getSharedInteraction(SLGI)
getSharedInteraction()所属R语言包:SLGI
Calculate the number of shared synthetic genetic interactions
计算共享合成的遗传相互作用
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The number of common synthetic genetic interacting partners between two genes.
常见的合成基因相互作用的两个基因之间的合作伙伴数量。
用法----------Usage----------
getSharedInteraction(iMat, mode="query")
参数----------Arguments----------
参数:iMat
Adjacency matrix reporting genetic Interactions. Each entry has value 0 or 1, representing positive or negative interaction of corresponding pairs of row and column, respectively.
邻接矩阵报告遗传相互作用。每个条目都有值0或1,表示积极或消极的相互作用相应的对行和列分别。
参数:mode
Character vector of value "query" or "target"
特征向量的值“查询”或“目标”
值----------Value----------
A numeric vector of the number of common genetic interactions between a pair of query or target genes.
一种常见的遗传一双查询或靶基因之间的相互作用的数值向量。
作者(S)----------Author(s)----------
N. LeMeur
参见----------See Also----------
congruence
congruence
举例----------Examples----------
intM <- matrix(c(0,1,0,0,1,1,1,0,1,0,0,1,1,0,1,0),
nrow=4, ncol=4,
dimnames=list(c("p1","p2","p3","p4"),
c("p1","p3","p5","p7")))
sharedInt <- getSharedInteraction(intM)
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