R语言 siggenes包 plotFindArguments()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotFindArguments(siggenes)
plotFindArguments()所属R语言包：siggenes

                                        Plot Arguments
                                         图参数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Utility function for generating a plot of the posterior probabilities in an html file when searching for the optimal value of the fudge factor in an  EBAM analysis.
软糖因素在EBAM分析寻找最佳值时，生成了一个HTML文件中的后验概率图的实用功能。


用法----------Usage----------


  plotFindArguments(onlyTab = FALSE, logit = TRUE, pos.legend = NULL,
        legend.cex = 0.8, col = NULL, main = NULL, xlab = NULL, ylab = NULL,
        only.a0 = FALSE, lty = 1, lwd = 1, y.intersp = 1.1)



参数----------Arguments----------

参数：onlyTab
if TRUE, then this plot is not generated and only the table of the number of differentially expressed genes and the estimated FDR for the different values of the fudge factor is shown.
TRUE如果，那么这个图是不会生成和显示表的差异表达基因的数量和蒙混因素的不同值估计FDR。


参数：logit
should the posterior probabilities be logit-transformed before they are plotted?
的后验概率被罗吉特改造之前，他们绘制的？


参数：pos.legend
an integer between 0 and 4. See help.finda0(plot) for how pos.legend can be specified, and for its default.
0和4之间的整数。看到help.finda0(plot)如何pos.legend可以指定，并为它的默认。


参数：legend.cex
the size of the text in the legend relative to the default size
传说中的相对文字的大小，默认大小


参数：col
a vector specifying the colors of the lines for the different values of the fudge factor. For a description of how colors can be specified, see par.
向量蒙混因素的不同值指定线的颜色。对于如何可以指定颜色的描述，请参阅par。


参数：main
a character string naming the main title of the plot.
一个字符串，命名图的主标题。


参数：xlab
a character string naming the label of the x axis.
一个字符串，命名为X轴的标签。


参数：ylab
a character string naming the label of the y axis.
一个字符串，命名为y轴的标签。


参数：only.a0
if TRUE, only the values of a0 are shown in the legend. If FALSE, both the values of a0 and the corresponding number of differentially expressed genes are shown.
如果TRUE，a0传说中的值。如果FALSE，a0和相应数量的差异表达基因的两个值显示。


参数：lty
a value or vector specifying the line type of the curves. For details, see par.
值或指定的曲线线路类型的向量。有关详细信息，请参阅par。


参数：lwd
a numeric value specifying the width of the plotted lines. For details, see par.
一个数值，指定绘制线条的宽度。有关详细信息，请参阅par。


参数：y.intersp
a numeric value specifying the space between the rows of the legend.
数值指定的传说行之间的空间。


值----------Value----------

A list required by ebam2html if findA0 is specified.
ebam2html如果findA0指定所需的列表。


作者（S）----------Author(s)----------


Holger Schwender, <a href="mailto:holger.schw@gmx.de">holger.schw@gmx.de</a>



参见----------See Also----------

ebam2html
ebam2html

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注：
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