R语言 ShortRead包 SpTrellis-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SpTrellis-class(ShortRead)
SpTrellis-class()所属R语言包：ShortRead

                                        Class "SpTrellis"
                                         类“SpTrellis”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A reference class to manage the trellis graphics related component of the  Snapshot functionality for visualization of genomic data.
参考类基因组数据的可视化管理的格子图形Snapshot功能的相关组件。


用法----------Usage----------


SpTrellis(trellis, debug_enabled=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：trellis
A trellis object for storing the plot of the genome area being  visualized.
一个网格对象存储的基因组区域的可视化的图。


参数：debug_enabled
logical(1) indicating whether class methods should report debugging information to the user.
logical(1)表示类的方法是否应该向用户报告调试信息。


领域----------Fields----------




trellis: Object of class trellis for storing the plot
类trellis存储图trellis：对象




debug_enabled logical(1) indicating whether class methods
debug_enabledlogical(1)指示是否类的方法


方法----------Methods----------




zi signature(x="SpTrellis"): zoom in
子signature(x="SpTrellis")：放大




zo signature(x="SpTrellis"): zoom out
ZOsignature(x="SpTrellis")：缩小




right signature(x="SpTrellis"): shift to the right
右signature(x="SpTrellis")：向右移动




left signature(x="SpTrellis"): shift to the left
离开signature(x="SpTrellis")：向左移动




restore signature(x="SpTrellis"): restore to the
恢复signature(x="SpTrellis")：恢复到




show signature(x="SpTrellis"): show the current plot
显示signature(x="SpTrellis")：显示当前的图




update signature(x="SpTrellis"): update the trellis
更新signature(x="SpTrellis")：更新格子


作者（S）----------Author(s)----------


Chao-Jen <a href="cwon2@fhcrc.org">cwon2@fhcrc.org</a>



参见----------See Also----------

Snapshot
Snapshot


举例----------Examples----------


col &lt;- c("#66C2A5", "#FC8D62")[66C2A5“，”＃FC8D62“）]
x = numeric(1000)
x[sample(1000, 100)] <- abs(rnorm(100))
df <- data.frame(x = c(x, -x), pos = seq(1, 1e5, length.out=1000),
                 group = rep(c("positive", "negative"), each=1000))
cv <- xyplot(x ~ pos, df, group=group, type="s",
             col=col, main="yeast chrI:1 - 2e5",
             ylab="Coverage", xlab="Coordinate",
             scales=list(y=list(tck=c(1,0)),
                         x=list(rot=45, tck=c(1,0), tick.number=20)),
             panel=function(...) {
                     panel.xyplot(...)
                     panel.grid(h=-1, v=20)
                     panel.abline(a=0, b=0, col="grey")
             })
s <- SpTrellis(cv)
s
zi(s)
zi(s)
left(s)
right(s)
zo(s)
restore(s)


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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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