R语言 ShortRead包 RtaIntensity-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

RtaIntensity-class(ShortRead)
RtaIntensity-class()所属R语言包：ShortRead

                                        Class "RtaIntensity"
                                         类“RtaIntensity”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Subclass of Intensity for representing image intensity data from the Illumina RTA pipeline.
子类的Intensity代表形象从Illumina的RTA的管道强度数据。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls to RtaIntensity or more usually readIntensities.
通过调用RtaIntensity或更通常的readIntensities的对象可以被创建。


插槽----------Slots----------

Object of RtaIntensity have slots:
RtaIntensity对象插槽：




readInfo: Object of class "RtaIntensityInfo"
readInfo类"RtaIntensityInfo"：对象




intensity: Object of class "ArrayIntensity" containing an array of intensities with dimensions read, base, and
intensity：Object类的"ArrayIntensity"含有阵列的强度与尺寸读的基础上，




measurementError: Object of class "ArrayIntensity" containing measurement errors for each read, cycle, and base, with dimensions like that for
measurementError：Object类的"ArrayIntensity"这样的尺寸，包含测量误差为每个读周期，碱基




.hasMeasurementError: Object of class "ScalarLogical" used internally to indicate whether
.hasMeasurementError：Object类的"ScalarLogical"内部使用，以表明是否


延伸----------Extends----------

Class "SolexaIntensity", directly.
类"SolexaIntensity"，直接。

Class "Intensity", by class "SolexaIntensity", distance 2.
类"Intensity"，由类“SolexaIntensity”，距离为2。

Class ".ShortReadBase", by class "SolexaIntensity", distance 3.
类".ShortReadBase"，由类“SolexaIntensity”，距离3。


方法----------Methods----------

Class "RtaIntensity" inherits accessor, subsetting, and display methods from class SolexaIntensity.
存取类“RtaIntensity”继承，子集，从类SolexaIntensity显示方法。


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Morgan <mtmorgan@fhcrc.org>



参见----------See Also----------

SolexaIntensity, readIntensities
SolexaIntensity，readIntensities


举例----------Examples----------


showClass("RtaIntensity")
showMethods(class="RtaIntensity", where=getNamespace("ShortRead"))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。