R语言 ShortRead包 QualityScore()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

QualityScore(ShortRead)
QualityScore()所属R语言包：ShortRead

                                        Construct objects indicating read or alignment quality
                                         构建对象表示读或校准质量

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Use these functions to construct quality indicators for reads or alignments. See QualityScore for details of object content and methods available for manipulating them.
使用这些函数来读取或路线的建设质量指标。看到QualityScore对象的内容和方法可用于操纵它们的细节。


用法----------Usage----------


NumericQuality(quality = numeric(0))
IntegerQuality(quality = integer(0))
MatrixQuality(quality = new("matrix"))
FastqQuality(quality, ...)
SFastqQuality(quality, ...)



参数----------Arguments----------

参数：quality
An object used to initialize the data structure. Appropriate objects are indicated in the constructors above for Numeric, Integer, and Matrix qualities. For FastqQuality and SFastqQuality, methods are defined for BStringSet, character, and missing.
数据结构用来初始化一个对象。在上面的数字，整数和矩阵素质的建设者表示合适的对象。 FastqQuality和SFastqQuality，BStringSet，character，missing定义方法。


参数：...
Additional arguments, currently unused.
额外的参数，目前尚未使用。


值----------Value----------

Constructors return objects of the corresponding class derived from QualityScore.
构造函数返回从QualityScore得到相应类的对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Morgan <mtmorgan@fhcrc.org>



参见----------See Also----------

QualityScore, readFastq, readAligned
QualityScore，readFastq，readAligned


举例----------Examples----------


nq <- NumericQuality(rnorm(20))
nq
quality(nq)
quality(nq[10:1])

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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