R语言 ScISI包 sumStats()函数中文帮助文档(中英文对照)

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sumStats(ScISI)
sumStats()所属R语言包：ScISI

                                        A function to calculate some summary statistics between an two
                                         一个函数来计算汇总统计数据之间的两部分

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes in a named list of in silico interactomes (by its incidence matrix representation of the bi-partite graph). The function compares each interactome pairwise (with itself as well as with each other interactome) and generates some summary statistics: e.g. the number of redundant protein complexes, the number of protein sub-complexes one interactome may posses with respect to some other interactome (possibly itself), etc.
此功能需要在一个名为列表中的的硅片interactomes（通过其发病率的双分图的矩阵表示）。函数比较每个成对相互作用组（与本身以及与对方的相互作用组），并产生了一些汇总统计例如：多余的蛋白质复合物的数量，与其他一些相互作用组蛋白亚复合体相互作用组5月拥有的数量（可能本身）等。


用法----------Usage----------


sumStats(imList, pathToSave = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：imList
A named list of in silic interactomes (incidence matrix)
一个在silic interactomes命名名单（关联矩阵）


参数：pathToSave
A character vector of a path location to where the summary statistics will be saved
汇总统计数据将被保存的路径位置的特征向量


值----------Value----------


参数：redundantM
A symmetric matrix with the row and column names named by the interactome names. The shows the number of redundancies (i.e. the number of repeated protein complexes) within two interactomes
一个对称矩阵的相互作用组的名字命名的行和列名。在两年内interactomes显示裁员人数（即重复的蛋白质复合物的数量）


参数：subM
A matrix with the row and column names named by the interactome names. Each entry details how many protein sub-complexes are found within the interactome indexed by the row with respect to the interactome indexed by the column
一个矩阵的行和列名的相互作用组的名字命名的。每个条目的细节多少行索引列索引的相互作用组相互作用组内蛋白质络合物


作者（S）----------Author(s)----------


TC



举例----------Examples----------


#gavin &lt;- getAPMSData("Gavin")[郭云< -  getAPMSData（“加文”）]
#krogan &lt;- getAPMSData("Krogan")[krogan < -  getAPMSData（“Krogan”）]
#imList &lt;- vector("list", length=2)[网店加盟< - 向量（“名单”，长度= 2）]
#imList[[1]] &lt;- gavin[网店加盟[1] < - 郭云]
#imList[[2]] &lt;- krogan[网店加盟[2] < -  krogan]
#names(imList) &lt;- c("Gavin", "Krogan")[名称（网店加盟） -  C（“加文”，“Krogan”）]

#sumStats(imList)[sumStats（网店加盟）]


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