R语言 ScISI包 runAlignment()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

runAlignment(ScISI)
runAlignment()所属R语言包：ScISI

                                        A function to establish preliminaries for the
                                         函数建立的预赛

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function creates the record keeping bijMat and calls the compBijection function.
这个函数创建的纪录保持bijMat和调用compBijection功能。


用法----------Usage----------


runAlignment(TSNMat, estMat, c2kMat)



参数----------Arguments----------

参数：TSNMat
The first bipartite graph matrix
第一个二分图矩阵


参数：estMat
The second bipartite graph matrix
第二个二分图矩阵


参数：c2kMat
The matrix of similarity index between TSNMat and estMat
矩阵的相似性指数之间TSNMat和estMat


值----------Value----------

The matrix bijMat with an alignment calculated by the function compBijection
与功能compBijection计算对齐的矩阵bijMat


作者（S）----------Author(s)----------


Tony Chiang



举例----------Examples----------


#go = getGOInfo()[去= getGOInfo（）]
#mips = getMipsInfo()[MIPS = getMipsInfo（）]
#goM = createGOMatrix(go)[GOM = createGOMatrix（去）]
#mipsM = createMipsMatrix(mips)[mipsM = createMipsMatrix（MIPS）]
#cc = runCompareComplex(mipsM, goM, byWhich = "ROW")[CC = runCompareComplex（mipsM，GOM，byWhich =“列”）]
#align = runAlignment(mipsM, goM, cc$simInd)[对齐= runAlignment（mipsM，GOM，CC simInd）]

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注：
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