找回密码
 注册
查看: 675|回复: 0

R语言 ScISI包 graphSumStats()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-26 13:55:46 | 显示全部楼层 |阅读模式
graphSumStats(ScISI)
graphSumStats()所属R语言包:ScISI

                                        An initiation function to generate graph statistics
                                         一个启动功能,生成图表统计

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes an in silico interactome and a list of Y2H experimental data (see details) and generates various graph summary statistics.
此功能需要在硅片相互作用组和酵母双杂交实验数据列表(见详情),并生成各种图表汇总统计。


用法----------Usage----------


graphSumStats(ISI, bait2PreyL)



参数----------Arguments----------

参数:ISI
An incidence matrix representation of a bi-partite graph of an in silico interactome
一个硅片相互作用组的双向三方在图的关联矩阵表示


参数:bait2PreyL
A list of y2h information. The data structure is that of intactInfo.rda of the y2hStat package
列表一个Y2H信息。数据结构是intactInfo.rda的y2hStat包


值----------Value----------


参数:complex
A character vector of the constituent members of the proteinn complex of interest
一个成员的利益proteinn复杂的特征向量


参数:complexBait
A character vector of those protein members which were also tested as baits in the y2h experiment
这些蛋白质成员的一个特征向量也Y2H实验测试为诱饵


参数:notBait
A character vector of those protein members which were not tested as baits
一个不作为诱饵测试这些蛋白质成员的特征向量


参数:avgDegOut
The average out-degree of the bait proteins of the complex of interest
平均出度复杂的利益诱饵蛋白


参数:notIsolated
A character vector of proteins that showed experimental binary affiliation for some other complex member
实验表明一些复杂的其他成员二进制联系的一种蛋白质的特征向量


参数:y2hGraph
An instance of the class graph; a graphNEL induceds Y2H graph on the protein complex
一个类图的实例; graphNEL induceds的Y2H对蛋白质复杂的图形


参数:popMeanDegree
The population mean degree derived from the bait proteins
来自诱饵蛋白的人口平均程度


参数:edgeProp
The estimated edge proportions derived between undirected Y2H edges
估计边缘之间无向的Y2H边缘的比例


参数:degBait
A named list; each name corresponds to each member of the protein complex with the entry the number of proteins to which it is adjacent
命名名单;条目,每个名字对应的蛋白复合物的每个成员的蛋白质的数量,它是相邻


作者(S)----------Author(s)----------


T Chiang

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-1-24 16:44 , Processed in 0.032672 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表