Class "samroc.result" for results of the function samrocN
类的“samroc.result”的功能samrocN结果
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The class samroc.result is the output of a call to samrocN and the input of various other
类samroc.result是一个调用samrocN和其他各种输入输出
插槽----------Slots----------
d: Object of class "numeric". Observed test statistic.
d:类“数字”的对象。观察检验统计量。
diff: Object of class "numeric". Estimate of effect, e.g. difference between group means.
diff:类“数字”的对象。估计的影响,例如组方式的区别。
se: Object of class "numeric". Standard error of diff.
se:类“数字”的对象。 diff标准错误。
d0: Object of class "matrix". Permutation test statistics.
d0:类“矩阵”的对象。置换的测试统计。
p0: Object of class "numeric". The estimated proportion unaffceted genes.
p0:类“数字”的对象。估计比例unaffceted基因。
s0: Object of class "numeric". The fudge factor.
s0:类“数字”的对象。软糖因素。
pvalues: Object of class "numeric". The p-values.
pvalues:类“数字”的对象。 P-值。
N.list: Object of class "integer". The optimal top list size among the sizes suggested.
N.list:“整数”类的对象。顶部列表的大小尺寸之间的最佳建议。
errors: Object of class "numeric". The sum of false postives and false negatives given a list that includes the
errors:类“数字”的对象。在假postives和假阴性的总和给出一个列表,其中包括
formula: Obeject of class "formula". The linear model formula used.
formula:Obeject类“公式”。线性模型公式中使用。
contrast: Object of class "numeric". The contrast estimated.
contrast:类“数字”的对象。对比估计。
annotation: Object of class "character". Annotation or comments regarding the analysis. By default the date.
annotation:“人物”类的对象。注释或分析意见。由默认的日期。
N.sample: Object of class "integer". The number of samples.
N.sample:“整数”类的对象。样本数。
B: Object of class "integer". The number of premutations.
B:“整数”类的对象。数量的premutations。
call: Object of class "character". The call to the function.
call:“人物”类的对象。函数调用。
id: Object of class "character". The probeset ids.
id:“人物”类的对象。 probeset IDS。
error.df: Object of class "integer". The error degrees of freedom.
error.df:“整数”类的对象。自由的错误程度。
design: Object of class "matrix". The design matrix.
design:类“矩阵”的对象。设计矩阵。
方法----------Methods----------
show (samroc.result): Summarizes the test result.
秀(samroc.result):总结测试结果。
plot (samroc.result): Plots the density of the observed test statistic and that of the corresponding null distribution
图(samroc.result):图解观测试验统计和相应的空分布的密度