pava.fdr(SAGx)
pava.fdr()所属R语言包:SAGx
Estimate of the FDR and the proportion unchanged genes
估计FDR和比例不变的基因
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Estimates tail area and local false discovery rate using isotonic regression
估计尾部面积和本地虚假的发现率,使用等渗回归
用法----------Usage----------
pava.fdr(ps = pvalues, p0 = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:ps
the vector of p-values, e.g. from firstpass
p值,例如向量从firstpass
参数:p0
an estimate of the proportion unchanged genes
估计比例不变基因
Details
详情----------Details----------
If p0 = NULL the PRE estimate of p0 is calculated.
如果P0 = NULL的P0预估计的计算方法。
值----------Value----------
a list with components
一个组件的列表
参数:pava.fdr
estimate of the FDR
估计的FDR
参数:p0
estimate of p0
P0的估计
参数:pava.local.fdr
estimate of the local fdr
估计当地FDR
作者(S)----------Author(s)----------
Per Broberg
参考文献----------References----------
Aubert J, Bar-Hen A, Daudin J-J, Robin S: Determination of the differentially expressed genes in microarray experiments using local FDR. BMC Bioinformatics 2004, 6(1):125
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