gap(SAGx)
gap()所属R语言包:SAGx
GAP statistic clustering figure of merit
Gap统计的数字聚类的优点
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Calculates a goodness of clustering measure based on the average
善良的基础上平均计算聚类的措施
用法----------Usage----------
gap(data = swiss,class = g, B = 500, cluster.func = myclus)
参数----------Arguments----------
参数:data
The data matrix, with samples (observations) in rows and genes (variables)in columns
与样本数据矩阵,行和基因(观察)(变量)在列
参数:class
a vector descibing the cluster memberships of the rows of data
矢量descibing的数据行的聚类成员
参数:B
the number of bootstrap samples
引导样品的数量
参数:cluster.func
a function taking the arguments data and k (number of clusters) and outputs cluster assignments as list elements cluster ( accessed by object$cluster ).
功能参数data和k(数字聚类)和产出的聚类作业列表元素cluster(访问object$cluster)。
值----------Value----------
The GAP statistic and the standard deviation
GAP的统计和标准偏差
作者(S)----------Author(s)----------
Per Broberg
参考文献----------References----------
via the Gap statistic. Technical Report Stanford
举例----------Examples----------
library("MASS")
data(swiss)
cl <- myclus(data = swiss, k = 3)
gap(swiss,cl$cluster)
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