clin2mim(SAGx)
clin2mim()所属R语言包:SAGx
Output a script file to WinMIM, linking clinical data and gene expression
输出脚本文件到WinMIM,将临床数据和基因表达
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a clinical variable, it produces a script file for WinMIM by calculating means and covariances and for the N most highly correlated probes (in absolute value). Here N is an input parameter, but a recommended value 10. WinMIM can find
鉴于临床变量,它产生的计算方法和协方差和最高度相关的探针(绝对值)为N为WinMIM脚本文件。在这里,N是一个输入参数,但建议值10。 WinMIM可以找到
用法----------Usage----------
clin2mim(variable="FEV1.ACTUAL",data=dbs,clindat=clinical,probes=probes,N=10,out="mimscr.txt")
参数----------Arguments----------
参数:variable
Clinical variable to be examined
临床变量进行审查
参数:data
The input data set, with subject id in first column.
输入数据集,须在第一列的ID。
参数:clindat
The input clinical data, with subject id in first column
临床数据的输入与主体的ID,在第一列
参数:probes
The name of the probes in the order of data
为了在数据探针的名称
参数:N
The number of highly correlated probes to be studied
研究高度相关的探针数量
参数:out
The MIM script file
MIM脚本文件
值----------Value----------
The correlation matrix
相关矩阵
注意----------Note----------
David Edwards' program WinMIM can be found on StatLib (http://lib.stat.cmu.edu/graphmod/). In MIM issue input mimscript.txt and the calculations to find a model will start. When finished go to the Graphics menu and
大卫·爱德华兹的程序WinMIM可以发现对StatLib(http://lib.stat.cmu.edu/graphmod/)。的MIM问题input mimscript.txt和计算模型将开始。当完成到图形菜单
作者(S)----------Author(s)----------
Per Broberg
参考文献----------References----------
Lautitzen, Steffen (1996) Graphical Models. Oxford University Press <br> Whittaker, Joe (1990) Graphical Models in Multivariate Analysis. Wiley <br>
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