R语言 sagenhaft包 sage.utilities()函数中文帮助文档(中英文对照)

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sage.utilities(sagenhaft)
sage.utilities()所属R语言包：sagenhaft

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                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Different utilities to use with SAGE data.
不同的工具来使用SAGE数据。


用法----------Usage----------


tagnum2tagmatrix(tags, length)
tagmatrix2tagnum(tags, length=ncol(tags))
tagnum2tagsequence(tags, length)
tagsequence2tagnum(tags, length)
revcomp(seq)



参数----------Arguments----------

参数：tags
integer or character vector giving SAGE tags.
整数或字符向量SAGE标签。


参数：length
Length of SAGE tags.
SAGE标签的长度。


参数：seq
Character vector or list of sequences.
序列的特征向量或列表。


参数：...
SAGE library objects.
SAGE库中的对象。


Details

详情----------Details----------

These functions are utility functions used in SAGE tag extraction, e.g. to convert SAGE tag sequences to numeric values, i.e. base 4 for efficient storage and handling, and to reverse complement sequences.
是在耆标签提取，如使用这些功能的实用功能耆标签序列转换成数值，即高效的存储和处理碱基4，反向互补序列。


作者（S）----------Author(s)----------


Tim Beissbarth



举例----------Examples----------


library(sagenhaft)
tags <- c("aaa", "ttt", "ccc")
tagsnumeric <- tagsequence2tagnum(tags, 3)
tagsmatrix <- tagnum2tagmatrix(tagsnumeric, 3)
tags <- tagnum2tagsequence(tagmatrix2tagnum(tagsmatrix, 3), 3)
revcomp(tags)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。