GenomicSelection(rtracklayer)
GenomicSelection()所属R语言包:rtracklayer
Genomic data selection
基因组数据的选择
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Convenience constructor of a RangedSelection object for selecting a data on a per-chromosome basis for a given genome.
便捷构造RangedSelection对象为每一个给定的基因组染色体基础上选择数据。
用法----------Usage----------
GenomicSelection(genome, chrom = NULL, colnames = character(0))
参数----------Arguments----------
参数:genome
A string identifying a genome. Should match the end of a BSgenome package name, e.g. "hg19".
一个确定的基因组的字符串。应符合一个BSgenome包名,例如: “hg19”。
参数:chrom
Character vector naming chromosomes to select.
特征向量命名染色体选择。
参数:colnames
The column names to select from the dataset.
从数据集选择的列名。
值----------Value----------
A RangedSelection object, selecting entire chromosomes
一个RangedSelection对象,选择整个染色体
作者(S)----------Author(s)----------
Michael Lawrence
参见----------See Also----------
RangedSelection, BigWigSelection
RangedSelection,BigWigSelection
举例----------Examples----------
# every chromosome from hg19[每一个染色体hg19]
GenomicSelection("hg19")
# chr1 and 2 from hg19, with a score column[chr1和2从hg19,得分列]
GenomicSelection("hg19", c("chr1", "chr2"), "score")
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