sepScores(RTopper)
sepScores()所属R语言包:RTopper
A list of separate gene-to-phenotype association scores, obtained indipendently for each distinct data set to be used to run the examples in the RTopper package
一个单独的基因表型的关系,为每一个不同的数据设置用于运行在RTopper包的例子indipendently获得分数,列表
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A list containing distinct named numeric vectors corresponding to the gene-to-phenotype association scores resulting from the sepatate analysis of each data set. These separate gene-to-phenotype scores are compurted by computeDrStat function. Can be used as input to runBatchGSE.
一个list含有不同的命名numeric向量对应每个数据集sepatate分析产生的基因表型的关联分数。这些单独的基因表型的分数compurted由computeDrStat的功能。可以作为输入runBatchGSE。
用法----------Usage----------
data(sepScores)
格式----------Format----------
This object is a list of length four, one element for data set:
这个对象是一个list长度为4,数据集的一个元素:
"dat.affy": a numeric vector of length 500, corresponding to the sepatate phenotype association scores computed for Affymetrix gene expression data;
"dat.affy":numeric长度为500,相应的sepatate型协会Affymetrix公司的基因表达数据的计算分数的向量;
"dat.agilent": a numeric vector of length 500, corresponding to the separate phenotype association scores computed for Agilent gene expression data;
"dat.agilent":numeric长度为500,对应单独的表型关联安捷伦基因表达数据的计算分数的向量;
"dat.cnvHarvard": a numeric vector of length 500, corresponding to the separate phenotype association scores computed for Harvard CNV data;
"dat.cnvHarvard":numeric长度为500,对应的独立型协会哈佛CNV的数据计算分数的向量;
"dat.cnvMskcc": a numeric vector of length 500, corresponding to the separate phenotype association scores computed for the MSKCC CNV data;
"dat.cnvMskcc":numeric长度为500,对应的单独的表型关联MSKCC CNV的数据计算分数的向量;
源----------Source----------
Computed using the computeDrStat function from the TCGA data contained in data.
电脑使用computeDrStat函数从data载的TCGA数据。
举例----------Examples----------
data(sepScores)
class(sepScores)
names(sepScores)
str(sepScores)
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注:
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