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R语言 RTopper包 fgsList()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:35:42 | 显示全部楼层 |阅读模式
fgsList(RTopper)
fgsList()所属R语言包:RTopper

                                         A list of Functional Gene Set (FGS) to be used to run the examples in the RTopper package
                                         被用来运行例子在RTopper包的功能基因组的列表(佛光山)

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A list containing distinct types of FGS (i.e. Gene Ontology, KEGG pathways). Each FGS is type is a list of named chararacter vectors, one for each FGS, containing the gene identifiers.  Vectors names describe the FGS. Can be used as input to runBatchGSE.  
一个list包含佛光山的不同类型(即基因本体,KEGG通路)。每个FGS的类型是一个名为list向量,每个佛光chararacter的,含有基因标识。向量名描述佛光山。可以作为输入runBatchGSE。


用法----------Usage----------


data(fgsList)



格式----------Format----------

This object is a list of length two:
这个对象是一个list的长度为二:

"go": this is a list of 5 character vectors, corresponding to 5 distinct Gene Ontology (GO) terms. Genes annotated to each GO term are identified by their gene symbol;
"go":这是一个5list向量,相应的5个不同的基因本体(GO)的条款character的。每个GO术语注释的基因被确定由他们的基因符号;

"kegg": this is a list of 5 character vectors, corresponding to 5 distinct KEGG pathways. Genes annotated to each KEGG pathway are identified by their gene symbol;
"kegg":这是一个list5character向量,相应的5个不同的KEGG通路。注明每个KEGG通路的基因被确定由他们的基因符号;


源----------Source----------

The FGS were obtained from the org.Hs.eg.db pakage, (use the org.Hs.eg function to see the content); These FGS were annotated using data from GO.db and KEGG.db packages (use the GO and KEGG functions to see the content).
佛光取自org.Hs.eg.dbpakage(使用org.Hs.eg功能看到的内容);这些佛光山注明GO.db和KEGG.db包(使用数据GO和KEGG功能看到的内容)。


举例----------Examples----------


data(fgsList)
class(fgsList)
names(fgsList)
str(fgsList)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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