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getData4DBFMCL(RTools4TB)
getData4DBFMCL()所属R语言包：RTools4TB

                                        Fetch an expression matrix from a file or an ExpressionSet object
                                         取从文件或ExpressionSet的对象表达矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function retrieves the expression matrix from a file or an ExpressionSet object. This is an internal function called by createSignatures4TB that should not be used directly.
此函数检索从一个文件或一个ExpressionSet对象表达矩阵。这是一个内部的功能由createSignatures4TB，不应直接使用。


用法----------Usage----------


getData4DBFMCL(data = NULL, filename = NULL, path = ".")



参数----------Arguments----------

参数：data
a matrix
矩阵


参数：filename
a character string representing the file name.
代表文件名字符串。


参数：path
A character string representing the data directory.
一个字符串表示的数据目录。


值----------Value----------

This function return a list which contains a matrix and a name. If filename is not equal to NULL, this name corresponds to the prefix of the given filename, in the other case name = NULL.
这个函数返回一个列表，其中包含了矩阵和一个名字。如果filename不等于为NULL，这个名字对应于给定的文件名的前缀，在其他情况下，名称= NULL。


警告----------Warnings----------

Convert data.frame, expressionSet or tab-delimited file to matrix class object. The input data must contain an expression matrix with gene as rows and samples as columns. Note that space characters inside gene names are not allowed (as they are not supported by the mcl command-line program).
转换成数据框，expressionSet或制表符分隔的文件，以矩阵类的对象。输入数据必须包含行和列的样本基因表达矩阵。需要注意的是空间内的基因名称的字符是不允许的（因为他们不是由MCL命令行程序支持）。


作者（S）----------Author(s)----------


Bergon A., Lopez F., Textoris J., Granjeaud S. and Puthier D.



参考文献----------References----------

flexible toolbox to explore productively the transcriptional landscape of the Gene Expression Omnibus database. PLoSONE, 2008;3(12):e4001.

参见----------See Also----------

createSignatures4TB
createSignatures4TB

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注：
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