R语言 RTools4TB包 clusterEisen()函数中文帮助文档(中英文对照)

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clusterEisen(RTools4TB)
clusterEisen()所属R语言包：RTools4TB

                                        Performs system call to the Cluster 3.0 program.
                                         聚类3.0程序执行系统调用。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function does a system call to the Cluster 3.0 program. It requires Cluster 3.0 to be installed on the machine and to be available in the path (as "cluster"). This internal function is used by createSignatures4TB. it performs only clustering of the columns (using a Pearson's correlation coefficient-based distance).
这个函数做一个聚类3.0程序的系统调用。它要求在计算机上安装聚类3.0和路径（“聚类”）。这个内部函数用于createSignatures4TB。它仅执行列（使用一个Pearson相关系数为基础的距离）的聚类。


用法----------Usage----------


clusterEisen(filename, median.center = FALSE, silent = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：filename
a character string representing the file name.
代表文件名字符串。


参数：median.center
a logical indicating whether rows should be median-centered.
逻辑指示是否行应是中位数为中心。


参数：silent
if set to TRUE, the progression of clustering is not displayed.
如果设置为TRUE，聚类的进展将不会显示。


Details

详情----------Details----------

Cluster was originally written by Michael Eisen (http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm) The command line version of Cluster version 3.0 (for Windows, Mac OS X, Unix, and Linux) was created by Michiel de Hoon, together with Seiya Imoto and Satoru Miyano.
最初是由迈克尔艾森（http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm）的Cluster版本3.0的命令行版本（适用于Windows，UNIX的Mac OS X和Linux）是由米歇尔·胡恩创建聚类，加上斗士井本和悟宫野。


警告----------Warnings----------

Only tested on UNIX-alikes plateforms.
只对UNIX的相似者plateforms测试。

Cluster 3.0 should be installed in its command-line only version:
聚类应安装在它的命令行版本3.0：

wget http://bonsai.ims.u-tokyo.ac.jp/~mdehoon/software/cluster/cluster-1.36.tar.gz
wget http://bonsai.ims.u-tokyo.ac.jp/~mdehoon/software/cluster/cluster-1.36.tar.gz

tar xvfz cluster-1.36.tar.gz
tar xvfz cluster-1.36.tar.gz

cd cluster-1.36/
cd cluster-1.36/

./configure --without-x
./configure --without-x

make
make

sudo make install
sudo make install

# You should get cluster in your path
# You should get cluster in your path

cluster -v
cluster -v

Please see http://bonsai.ims.u-tokyo.ac.jp/~mdehoon/software/cluster/software.htm for further informations.
请~mdehoon http://bonsai.ims.u-tokyo.ac.jp/ /软件/为进一步信息聚类/ software.htm的。


作者（S）----------Author(s)----------


Bergon A., Lopez F., Textoris J., Granjeaud S. and Puthier D.



参考文献----------References----------



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注：
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