TabixInput(Rsamtools)
TabixInput()所属R语言包:Rsamtools
Operations on ‘tabix’ (indexed, tab-delimited) files.
TABIX(索引,制表符分隔)文件的操作。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Scan compressed, sorted, tabix-indexed, tab-delimited files.
扫描压缩,排序,TABIX索引,制表符分隔的文件。
用法----------Usage----------
scanTabix(file, ..., param)
## S4 method for signature 'character,RangesList'
scanTabix(file, ..., param)
## S4 method for signature 'character,RangedData'
scanTabix(file, ..., param)
## S4 method for signature 'character,GRanges'
scanTabix(file, ..., param)
参数----------Arguments----------
参数:file
The character() file name(s) of the tabix file be processed, or more flexibly an instance of class TabixFile.
TABIX文件的文件名字符()()进行处理,或更灵活的类TabixFile的一个实例。
参数:param
A instance of GRanges, RangedData, or RangesList provide the sequence names and regions to be parsed.
一个GRanges,RangedData或RangesList提供的序列名称和区域进行解析实例。
参数:...
Additional arguments, currently ignored.
额外的参数,目前被忽略。
值----------Value----------
scanTabix returns a list, with one element per region. Each element of the list is a character vector representing records in the region.
scanTabix返回一个列表,每一个区域的元素。列表中的每个元素是一个特征向量,代表在该区域的记录。
作者(S)----------Author(s)----------
Martin Morgan <mtmorgan@fhcrc.org>.
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
example(TabixFile)
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注:
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