R语言 RLMM包 plot_theta()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plot_theta(RLMM)
plot_theta()所属R语言包：RLMM

                                        Allele Summary Plot
                                         等位基因摘要图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creates an Allele Summary plot (allele B vs. allele A) for each SNP specified in snpsfilename. The points in the plot are the (theta A, theta B) ordered pairs for all the samples of the SNP. If a plotfilename is specified,  it will save the plot as a .ps file, otherwise the plot is shown on screen.
创建一个等位基因概要图（B等位基因与A等位基因）每个SNP snpsfilename指定。积点（THETA一个THETA乙）下令对所有样品的SNP。如果plotfilename被指定，它会保存。ps文件作为一个图，否则显示在屏幕上的图。


用法----------Usage----------


plot_theta(genotypefile = "Xba.rlmm",
           thetafile = "Xba.theta",
           Pick.Obj = "FALSE",
           plotfile = "plots.ps",
           snpsfile = "snps.lst")



参数----------Arguments----------

参数：genotypefile
Character string specifying the directory AND name of the .rlmm file created by Classify (optional)
Classify（可选）创建。rlmm文件指定的目录和名称的字符串


参数：thetafile
Character string specifying the directory AND name of the .rlmm file created by Create_Thetafile (optional)
Create_Thetafile（可选）创建。rlmm文件指定的目录和名称的字符串


参数：Pick.Obj
At this point, it should always be left as the default FALSE, ie: it is for development purposes only (optional)
在这一点上，它应该总是留给默认是false，即：它是用于开发目的（可选）


参数：plotfile
The name where to store the plot as a .ps file, if blank such as "", it will display on screen instead (optional)
这个名字的地方。ps文件存储的图，如果空白，如“”，它会在屏幕上显示（可选）


参数：snpsfile
A list of SNPs to plot, with one SNP following another on a newline (optional)
一个SNP的列表，绘制一个SNP一个换行符（可选），另一个


作者（S）----------Author(s)----------


Nusrat Rabbee <nrabbee@post.harvard.edu>, Gary Wong
<wongg62@gmail.com>


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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