R语言 Ringo包 plot.cher()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plot.cher(Ringo)
plot.cher()所属R语言包：Ringo

                                        Plot identified Chers
                                         图确定Chers

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function for plotting identified Chers (ChIP-enriched regions).
图确定Chers（CHIP富集区域）的功能。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'cher,ExpressionSet'
plot(x, y, probeAnno, samples=NULL, extent = 1000, gff = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
object of class cher
对象类cher


参数：y
data object of class ExpressionSet that was used for function findChersOnSmoothed
ExpressionSet类的对象数据被用于函数findChersOnSmoothed


参数：probeAnno
object of class probeAnno holding the reporter/probe to genome mappings
类的对象probeAnno举行的记者/探针到基因组映射


参数：samples
which samples to plot, either a numeric vector of entries in 1 to ncol(dat), or character vector with entries in sampleNames(dat) or NULL meaning plot the levels from all samples in the ExpressionSet
样品的图，无论是参赛作品的数字矢量在1ncol(dat)或sampleNames(dat)或NULL意义小区在ExpressionSet的所有样本的水平条目特征向量


参数：extent
integer; how many base pairs to the left and right should the plotted genomic region be extended
整数;多少个碱基对的左侧和绘制基因组区域应该延长


参数：gff
data frame with gene/transcript annotation
数据框的基因/转录注解


参数：...
further arguments passed on to function chipAlongChrom
通过进一步的论据运作chipAlongChrom


值----------Value----------

called for generating the plot; invisible(NULL)
要求生成的图;invisible(NULL)


作者（S）----------Author(s)----------


Joern Toedling



参见----------See Also----------

chipAlongChrom, cher-class
chipAlongChrom，cher-class

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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