R语言 Ringo包 asExprSet()函数中文帮助文档(中英文对照)

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asExprSet(Ringo)
asExprSet()所属R语言包：Ringo

                                        converts a Ringo MAList into an ExpressionSet
                                         转换成一个ExpressionSet林檎MAList

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to convert an object of class MAList into an object of class ExpressionSet. Note that the otherwise optional targets component is required in this case to generate the phenoData of the new ExpressionSet.
功能转换MAList类ExpressionSet到对象类的一个对象。请注意，否则可选targets组件，在这种情况下，需要生成phenoData新的ExpressionSet。


用法----------Usage----------


asExprSet(from, idColumn="PROBE_ID")



参数----------Arguments----------

参数：from
object of class MAList to convert into an ExpressionSet
类对象MAList转换成ExpressionSet


参数：idColumn
string; indicating which column of the genes data.frame of the MAList holds the identifier for reporters on the microarray. This column, after calling make.names on it, will make up the unique featureNames of the resulting ExpressionSet.
字符串;genesMAList的数据框列持有记者芯片的标识符。此列，后调用make.names就可以了，将弥补由此产生的featureNames独特ExpressionSet。


值----------Value----------

an object of class ExpressionSet
一个对象类ExpressionSet


注意----------Note----------

There is a more general function for converting MALists to ExpressionSets in the package convert. This function here is solely intended for converting Ringo-generated MALists into ExpressionSets.
转换包convertMALists ExpressionSets有一个更一般的功能。此功能仅用于转换成MAList的林檎生成ExpressionSet的。


作者（S）----------Author(s)----------


Joern Toedling



参见----------See Also----------

ExpressionSet, preprocess
ExpressionSet，preprocess


举例----------Examples----------


  exDir <- system.file("exData",package="Ringo")
  exRG  <- readNimblegen("example_targets.txt","spottypes.txt",path=exDir)
  exMA  <- preprocess(exRG, "none", returnMAList=TRUE)
  exX   <- asExprSet(exMA)

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